Нашел эту старейшую нить в поиске решения своей проблемы:

>> "Мышь в X Window"
>> Сообщение от Dmitriy145  on 05-Авг-03, 15:03  (MSK)
>> При установке ASPLinux7.3 мышь работает нормально, и после первой перезагрузки стоит в >> центре экрана на окне авторизации, если мышь тронуть, то указатель забивается в правый >> верхний угол экрана, после этого смещеться он может только влево пока не отрываешь >> >> мышь от коврика, дальше - снова в угол. Замена мыши, и драйверов при устаноке Linux >> >> ничего не меняют.

Очень удивила схожесть симптомов.
Система FreeBSD6.0-RELEASE, X-Org-6.8.2. Правда там решения проблемы я не нашел, но хочу поделиться успешным результатом моего излюбленного "научного тыка".
За отсутствием должного опыта, был готов опустить руки, но все же предпринял последний шаг: закомментировал строку 'Option "Protocol" "PS/2"'

# Identifier and driver
    Identifier            "Mouse1"
    Driver                "mouse"
  # Option "Protocol"     "PS/2"
    Option "Device"       "/dev/sysmouse"

• Мышь в ,ПитерПен, 19:50 , 13-Дек-08

>[оверквотинг удален]
>последний шаг: закомментировал строку 'Option "Protocol" "PS/2"'
>
># Identifier and driver
>    Identifier        
>    "Mouse1"
>    Driver        
>        "mouse"
>  # Option "Protocol"     "PS/2"
>    Option "Device"      
>"/dev/sysmouse"

    Option "Protocol"    "Auto"
А так не пробовали?