Обсуждение статьи тематического каталога: FreeBSD Увеличение скорости файловых пересылок через Samba (samba speed sysctl freebsd optimization)Ссылка на текст статьи: http://www.opennet.me/base/net/samba_minifiles.txt.html
Он по любому будет тупить, потому что кэш винчестера не бесконечный. Это нормально.