URL: https://www.opennet.me/cgi-bin/openforum/vsluhboard.cgi
Форум: vsluhforumID3
Нить номер: 60377
[ Назад ]

Исходное сообщение
"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"

Отправлено opennews , 29-Окт-09 12:17 
Состоялся (http://opensource.scitouch.net/indigo/) первый публичный релиз пакета программ для органической химии под названием Indigo. Пакет состоит из пяти частей:

-  Bingo: картридж (плагин) к СУБД Oracle с реализацией различных видов «химического» поиска молекул и реакций.-  Dingo: библиотека для рендеринга молекул и реакций, с обёрткой на C# и command-line утилитой.-  Cano: библиотека для подсчёта canonical SMILES — уникального представления молекулы, с обёрткой на C#.-  Deco: библиотека и command-line утилита для разложения набора молекул на общую часть и заместители (R-Group deconvolution)-  Nucleo: библиотека для работы с нуклеотидными цепочками, с обёрткой на Java.


Все программы реализованы на C++. Поддерживаемые платформы - Windows, Linux, Mac OS X, Solaris на SPARC. Исходные тексты распространяются под лицензией GPL v3.

URL: http://opensource.scitouch.net/indigo/
Новость: http://www.opennet.me/opennews/art.shtml?num=24031


Содержание

Сообщения в этом обсуждении
"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено Zenitur , 29-Окт-09 12:17 
Жду когда включат в основной состав дистрибутивов.

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено abra , 29-Окт-09 12:40 
Какой химией занимаемся?

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено BirdGovorun , 29-Окт-09 13:55 
Наверное этой
C21H23NO5
или этой
C7H5N3O6

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено От автора , 30-Окт-09 11:52 
Это станет возможным, когда появятся пользователи.

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено аноним , 29-Окт-09 15:48 
Господи, oracle, c# и java. Ничего себе коктейль, работать только в закрытом помещении - слетаются сотни мух. Правда, люди от вони дохнут.

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено Warhead Wardick , 29-Окт-09 17:20 
Проект открытый - перепиши на чем кошерном вместо того чтобы тут <beeeeep>

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено Аноним , 29-Окт-09 20:56 
пусть авторы переписывают

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено От автора , 29-Окт-09 21:07 
Будьте конструктивнее, пожалуйста. Прекратите истерику и скажите, что бы вы советовали нам переписать и как именно.

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено аноним , 30-Окт-09 04:26 
Где вы увидели истерику? Выкиньте все обертки для недоязыков, потому что java - это тормоза и память в помойку, а mono - то же самое + патенты. Кроме того, плагин перепишите под postgres, а oracle - нигде не используемая проприетарная недоБД.

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено От автора , 30-Окт-09 11:29 
Совет выкинуть обёртки -- это неконструктивно, извините. Обёртки были сделаны для того, чтобы использовать наши компоненты в конкретных проектах, написанных на C# и Java. Очевидно, люди из-за нас не стали бы переписывать их на чём-либо ещё.

Что касается Oracle: вы будете удивлены, но она используется во многих фармацевтических компаниях, а postgres в них не очень известен. Однако, порт на postgres в принципе возможен.


"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено Serg , 30-Окт-09 17:48 
> Совет выкинуть обёртки -- это неконструктивно, извините. Обёртки были сделаны для того, чтобы использовать наши компоненты в конкретных проектах, написанных на C# и Java.

Мне кажется выкидывать обертки, если они уже есть, смысла нет, но главное - чтобы инструментами можно было пользоваться не прибегая к java/mono вообще. Нативному коду всегда надо отдавать предпочтение.

А про oracle не соглашусь - я как раз postgres видел много где. Часто именно с oracle на него переходят.


"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено от автора , 30-Окт-09 18:27 
>главное - чтобы инструментами можно было пользоваться не прибегая к java/mono вообще.
>Нативному коду всегда надо отдавать предпочтение.

Конечно. Взгляните на страницу "Downloads" на сайте -- для всех библиотек есть C-интерфейсы.

>А про oracle не соглашусь - я как раз postgres видел много
>где. Часто именно с oracle на него переходят.

Если появятся заказы, то и мы непременно реализуем поддержку postgres.


"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено От автора , 29-Окт-09 21:07 
Будьте конструктивнее, пожалуйста. Прекратите истерику и скажите, что бы вы советовали нам переписать и как именно.

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено Необъективный_ , 29-Окт-09 23:10 
Было бы неплохо добавить "обёртку" на Qt, GTK+ или wxWidgets. Пакету светлого будущего, авторам успехов.

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено От автора , 29-Окт-09 23:26 
Спасибо. Обёртки, действительно, ожидаются в недалёком будущем.

"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено аноним , 30-Окт-09 04:27 
>Спасибо. Обёртки, действительно, ожидаются в недалёком будущем.

Вот-вот, люди правильно говорят. Qt было бы идеальным.


"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено аноним , 30-Окт-09 18:40 
>>Спасибо. Обёртки, действительно, ожидаются в недалёком будущем.
>
>Вот-вот, люди правильно говорят. Qt было бы идеальным.

Уважаемый, внесите ясность пожалуйста. Для чего обертки были бы идеальными и зачем они вообще здесь?



"Indigo: пакет open-source программ для органической химии"
Отправлено Аноним , 30-Окт-09 22:32 
По-моему, все понятно - народ хочет работать без использования тормозных, неэффективных и опасных технологий, как-то java, mono и oracle. Библиотеки, как понятно из новости, и так на C++, а хочется чтобы и front-end'ы были нативные и открытые.