URL: https://www.opennet.me/cgi-bin/openforum/vsluhboard.cgi
Форум: vsluhforumID3
Нить номер: 78246
[ Назад ]

Исходное сообщение
"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."

Отправлено opennews , 23-Июн-11 16:23 
После шести с половиной лет разработки увидела свет (http://ggasoftware.com/opensource) первая стабильная версия универсального SDK для химической информатики под названием Indigo (http://ggasoftware.com/opensource/indigo). История Indigo как проекта с открытыми кодом ведёт отсчёт с ноября 2009 года, когда был опубликован комплект утилит с ограниченным API. На данный момент Indigo предоставляет унифицированный программный интерфейс для разработчиков на язвках C/C++, Java, C# и Python.


Краткий список возможностей:


-  Поддержка форматов представления структур молекул и реакций: Molfile, Rxnfile, SDF, RDF, CML, SMILES, SMARTS
-  Двумерный рендеринг структур молекул и реакций по стандартам IUPAC (в качестве движка используется cairo). Автоматическое вычисление координат атомов в 2D
-  Вычисление "Canonical SMILES" - представления молекулярной структуры, инвариантного относительно перестановок атомов
-  Проверка точного совпадения структур молекул или реакций (Exact matching), п...

URL: http://ggasoftware.com/opensource
Новость: http://www.opennet.me/opennews/art.shtml?num=30974


Содержание

Сообщения в этом обсуждении
"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."
Отправлено Бедный бывший разработчик Novell , 23-Июн-11 16:23 
Вот это круть, вот и химпром обопенсорсился. Ура!

"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."
Отправлено Аноним , 23-Июн-11 18:07 
А говорят в опенсорс специализованного софта нет...

"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."
Отправлено Аноним , 23-Июн-11 21:02 
Еще как есть! И медицинский софт (при чем реалтаймовый для больниц и поддержки жизнедеятельности), и математика, и химия с биологией. Не слушай троллей, они много чего наговорить могут :)

"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."
Отправлено name , 24-Июн-11 00:02 
например, что?

"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."
Отправлено Варщик , 24-Июн-11 09:44 
>например, что?

Например HyperChem, NWChem, CFOUR, Columbus, GAMESS US, Priroda, MRCC, OpenThermo, а так же в некотором роде аналог Индиги Chemistry Development Kit.


"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."
Отправлено Dmitry Pavlov , 24-Июн-11 11:57 
Ещё RDKit, OpenBabel. Эти аналоги являются более близкими, т.к. написаны на C++.

"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."
Отправлено Варщик , 24-Июн-11 09:50 
>Ура!

Действительно ура, т.к. любой SDK позволяет в потенциале расширить список химсофта в разы.


"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."
Отправлено Антоним , 23-Июн-11 23:06 
он есть далеко не везде. Топик это таки ближе к академическим задачам, а это один из основных источников в опенсорсе.