Поддержка MySQL 4.0 будет прекращена через 2 недели, после этого, исправления критических ошибок и проблем безопасности для ветки 4.0 выпускаться не будут. Критические обновления для MySQL 4.1 будут выпускаться еще в течение года, а для 5.0 - еще трех лет.

По индивидуальным соглашениям компания Sun Microsystems готова продолжить коммерческую поддержку MySQL 4.0. Консалтинговая компания Percona также намерена обеспечить неофициальную коммерческую поддержку MySQL 4.0 и MySQL 3.23, путем бэкпортирования важных исправлений.

Последний релиз 4.0.30 вышел 12 февраля 2007 года, релиз MySQL 4.1.25 вышел две недели назад и содержал исправление краха при выполнении операции "INSERT INTO ... SELECT" при включенной опции innodb_locks_unsafe_for_binlog, бэкпортирование из ветки 5.1 поддержки переменной plugin_dir для ограничения загрузки пользовательских функций, устранение уязвимости, позволяющей через манипуляцию симлинками обойти некоторые ограничения при доступе к MyISAM таблицам в MySQL (перезапись файлов таблиц путем манипуляции с опциями "DATA DIRECTORY" и "INDEX DIRECTORY").