В руководстве "Detecting and Understading rootkits" описаны виды троянских программ, описываются средства для обнаружения закладок в системе.
Скорее всего основным залогом успеха станет взять в привычку регулярно патчить систему на премет различных уязвимостей... Второе - грамотно настраивайте брандмауер господа... Тады и не будут вас сканить, снифить, досить (то же самое, но за меньшие деньги "Дося") и т.д.
Не работайте под рутом ежедневно и без надобности!
Ну и так далее...
Продолжать можно до бесконечности.... Кто продолжит?