стоп. будем проще, иначе запутаем.1. уточню, для изучения подойдет любой известный, свежий, стабильный линукс дистрибутив.
Ваш дистрибутив староват, можете взять ту же мандриву, но свежее. Зачем вам проблемы 2006 года, когда есть новые свежие 2008 года выпуска :)
2. для любой оси включая винду существует список в инете подерживаемого оборудования.
Это значит что его можно найти, и сверится с ним. Сделать выводы.
3. используйте поиск на этом сайте и вообще поиск, найдете ответы на часть ваших вопросов.
У вас походу ядро 2.6.12, в те времена когда оно вышло были замечены различные проблемы с железом связанные с тем же ACPI (т.е. возможно его надо отключить в биос, и вообще биос надо сбросить в default, так линуху проще). Так же вроде там была проблема в ядре, но не у всех проявлялась. Вообще сейчас я занимаюсь телепатией, и пытаюсь угадать в чем проблема. Иногда проблемы в линукс бывают из-за того что он использует фичи железа которые не использует винда, как следствие в винде все быро вроде, а в линуксе медленно, но фичи могли быть некорректно реализованы в железе.
4. в каталоге var/log полно всяких логов их можно поизучать на предмет поиска странностей
утилита dmesg выводит список найденого оборудования, ее вывод тоже стоит поизучать, так же посмотреть что скажет hdparm для ваших дисков, особенно интересен параметр using_dma (должен быть 1)
и т.д. и т.п. :)