Очень часто нужно: открыл, исправил, сохранил. А в xcf сохраняется только промежуточный результат, что нужно относительно редко.У каждого конечно свои задачи, но опцию, возвращающую старое поведение, сделать нужно было однозначно. Если просьбы пользователей игнорируются, то это явно плохой UX.
Подобных странностей в открытом софте хватает - к примеру у blender запрашивается подтверждение каждый раз при нажатии на delete (удалить объект) и ctrl+s (сохранить). Это при том, что всегда можно сделать отмену для случайно удаленного или открыть автоматический backup при случайном сохранении. Одно хорошо - софт открыт и пропатчить такие мелочи не составляет большого труда. Но вот пользователи других ОС часто жалуются на подобный UX в свободном софте и в чем-то они правы.