Будем реалистами.Свою систему будем делать так:
1) Ставим спецпрограмму для работы с дистрами
2) Качаем дистрибутив Ubuntu-совместимый или на базе Ubuntu/ubuntu семейства (с помощью этой программы или нет, не важно)
3) После чего, с помощью спецпрограммы вносим ряд своих правок и изменений в дистрибутив (которые не ограничиваются сменой обоев и тем, иначе и смысла не было бы делать свою собственную ОС).
Хочется, чтобы при помощи программы, можно было:
Убирать копирайты, картинки-логотипы, названия ОС, названия программ... И вставлять свои;
Быстро менять и настраивать всевозможные темы, ярлыки, фоны;
Быстро пофиксить все найденные к тому времени баги (используя готовые решения разумеется;
Быстро править, убирать или добавлять пакеты;
Тонкая настройка сессий;
Изменение дефоултных настроек программ;
Автоматическое разруливание зависимостей, с отчётами.
Хотя бы это для начала.