>САБЖ?
Да.

>Если я поставлю на RH9 squid и настрою его как прозрачный прокси,
>то смогут ли люди пользоваться этим прокси?
Если сквид будет работать в обычном режиме, то пользователи _смогут_ им пользоваться, а в прозрачном режиме - _будут_, так как смысл прозрачого проксирования и есть в его незаметно добровольно-принудительном использовании.

>Какие могут быть проблемы?
Обычно от прокси только радость от ускорения/экономии трафика.