У тебя есть встроенная видеокарта? Если да - во всем виноват nouveau, который нестабилен, и эксперриментален. Предлагаю загрузиться со встроенной видеокартой и удалить этот драйвер насовсем. Лучше nv или nvidia тебе будет! :-)
В чем дело? Я заметил, что в Ubuntu 7.04-7.10 вместо стартового экрана системы - режим ожидания монитора. Затем все запускается и работает. В 8.04 поправили, в 10.04 появилось снова с новым nouveau. Ну ладно бы просто не виден стартовый экран - но есть новая функция - запуск X-сервера без мерцания экрана! А когда ты попробовал применить настройки, то получилось то же самое наверно. Советую нажать не на применить, а на сменить драйвер на nv, в крайнем случае на vesa.