>> Причина - различия в идеологии.
> Можно пару примеров разницы идеологий? Желательно с их проявлениями?

Например, в rpm установка пакетов в принципе неинтерактивна (хотя технически можно в %post сделать read, но librpm тогда за себя не отвечает), а сами пакеты имеют по дизайну жёсткие зависимости; всё это приводит к меньшей гибкости системы, но большей предсказуемости конечного результата в сравнении с dpkg или portage.  Соответственно если потянуть в сторону гибкости -- получим снижение жёсткости/предсказуемости/воспроизводимости.

Можно стараться держать пакетную базу "на гребне волны", но там вместе со свежайшими фичами/фиксами плавают и свежайшие баги/разломы.  Здесь в перетягивание каната играют новизна со стабильностью.

Есть и другие подобные выборы, которые приходится делать при определении дистрибутива; их набором дистрибутивы и отличаются по своей сути (сверх чего есть ещё различия реализации).

PS: скорее только не librpm, а то, что на ней дальше сидит (включая тот же synaptic).