Сначала создали себе проблему, потом героически её решают.

До Стима, игры устанавливались в директории, недоступные для записи пользователю. А сейвы и конфиги игр сохранялись в "~/.appname". Потом, правда, там создалась мусорка, и новые приложения начали сохранять это в "~/.local/share/appname"

Когда появился стим, игры стали устанавливаться в "~/.local/share/Steam/SteamApps/common", и сейвы хранить там же (!!!). Это проблема, с которой Valve борется в Windows, как с наследием Windows 98, когда не было разделения прав доступа! Раньше в Program Files можно было записывать файлы любому пользователю, а когда все перешли на WinNT, то только администратору! И все захотели слезть с прав администратора на права пользователя, но этому мешало то, что часть приложений сохраняет свои данные не в "Мои документы\My Games", а в Program Files! В линуксе этого не было изначально! А Steam это привнёс! Хотя мог наоборот, не создавать проблему изначально!