Попробую по памяти, чтобы быстрее (почти всё через расширения).

+PrimarySelection
+AlwaysOnTop
?Список открытых окон и координаты окон (должно быть, но получилось ужасно - координаты относительно top-level окна, имена окон чаще не проставлены, т.к. расширение свеженькое)
+Управление окнами (свернуть/развернуть)
+Скриншоты (прям годно)

-drag'n'drop кривой (второй клиент не видит drop; это намеренный баг в core protocol)
-эмуляция ввода - VNC/RDP/тестирование; скорее нет, но иногда есть варианты

?вывод в виджет другого процесса (workaround прям тяжёлый - эмуляция композитора, smplayer за такое не возьмется)
?GlobalHotkeys (скорее нет)
?Иконки в трее (полноценного аналога XEmbed нет; там тогда потеря функций типа хинтов, иконок в меню, анимации сложно сделать)
?область под панели (внешние панели; должно быть, но давно не смотрел)

Многие вещи не очень очевидны, но их нет. Например вкладку в konsole можно перетащить из окна одного процесса в другой. Wayland'у до таких высот пока далеко.

Хороший пример - поднять переписку разработчиков cairo dock с разработчиками weston. 10 лет назад все закончилось словами «это невозможно в wayland». Сегодня это уже теоретически возможно, или будет возможно в ближайшие несколько лет.