Ну вы удивили конечно своим ответом!
То что разные движки БД работают на одних и тех же запросах с одними и теми же данными по разному (а если учесть еще и настройки!), это, я думаю, всем и так понятно. Иначе зачем они были бы нужны? Вот если бы при переходе с одного движка на другой вдруг перестали работать запросы, ввиду того что что-то не поддерживается или поддерживается по другому. То это да, действительно нужно переписывать (ну или незначительно модифицировать) запрос. И совсем другое дело, когда ваш запрос использует СУБД специфичную "фичу", которая не поддерживается другой СУБД или она реализована по другому. Например, из моего опыта в запросе я использовал функцию TIMESTAMPDIFF (БД IBM DB2), вроде бы и работает и ладно. Однако, ведущий программист сказал переписать без использования СУБД специфичных функций, поскольку в firebird, такой функции вообще нет (он тоже у нас используется) ну а в mysql (для примера), она реализована по другому (другие входные параметры).
Вот вам и разница между разной работой движков, проявляющейся в разной производительности, и поддержкой всяких "фич" из-за которых действительно нужно переписывать (немного модифицировать) запрос.

P.S. Кто осилил поток сознания молодец :)
Ну а насчет взаимозаменяемости DB2 и firebird, разводить священные войны не стоит, акцент примера именно выполнение одного и того же запроса на разных СУБД.