Версия для печати

Руководство по mpich, переносимой реализации MPI

• Руководство по инсталляции mpich, переносимой реализации MPI, версии 1.2.2
• Руководство пользователя mpich, переносимой реализации MPI, версии 1.2.2

Contents

• Быстрый запуск
• Получение и распаковка дистрибутива
• Документация
• Конфигурирование mpich
  • Конфигурирование mpich для работы с различными компиляторами.
  • Рабочие станции в общем.
  • Сети рабочих станций с устройством ch_p4
  • Сети рабочих станций с устройством ch_p4mpd.
  • Вычислительные решетки с устройством globus2
  • Процессоры массового параллелизма и большие многопроцессорные системы
  • Построение mpich
  • Подготовка mpich для отладки в TotalView
  • Фортран
  • Специальные выпуски для гетерогенных сетей и устройства ch_p4
  • Настройка rsh
  • Конфигурация с помощью ssh
  • mpich и потоки
  • Процедуры MPI и PMPI
  
  
• Компиляция mpich
  • С++
  • Построение для множества устройств или архитектур
  
  
• Запуск программ MPI
  • Специальные дополнения о запуске в сети рабочих станций
  • Использование демонов MPD для устройства ch_p4mpd
  • Специальные дополнения о запуске в разделяемой памяти
  • NFS и MPI-IO
  
  
• Процесс тестирования
• Инсталляция mpich для коллективного использования
  • Команды пользователя
  • Установка документации
  
  
• Библиотека MPE
  • Опции конфигурации
  • Инструкции по инсталляции mpe
  • Примеры программ mpe
  • mpeinstall
  
  
• Визуализация поведения программ
  • Upshot
  • jumpshot
  
  
• Интернационализация
• Оценка производительности mpich
• Среда программирования mpich
  • Введение
  • mpirun, переносимый скрипт запуска
  • Команды компиляции и сборки программ
  
  
• Проблемы
  • Отсылка сообщений об ошибке
  • Проблемы конфигурирования
  • Проблемы построения mpich
  • Проблемы тестирования
  
  
• Использование configure
• Устаревшие возможности
  • Получение Tcl, Tk и wish
  • Устаревшие системы
  • mpireconfig, способ создания make-файлов
  
  
• Bibliography

Данный документ описывает процесс получения и инсталляции mpich [11], переносимой реализации стандарта передачи сообщений MPI. Детали использования реализации mpich приведены в отдельном руководстве пользователя mpich [8]. В mpich версии 1.2.2 в основном исправлены ошибки и увеличена возможность переносимости, особенно для кластеров на базе LINUX.

Новое в 1.2.2:

• Существенно улучшено устройство ch_p4mpd
• Улучшенная поддержка различных компиляторов Фортран и Фортран 90, включая вычисление констант Фортрана, используемых в реализации mpich, во время компиляции.
• Улучшенное устройство globus2, предоставляющее большую производительность.
• Новый режим bproc для устройства ch_p4 поддерживает Scyld Beowulf.
• Множественные улучшения производительности TCP для устройств ch_p4 и ch_p4mpd.
• Множество исправлений и улучшений кода. См. www.mcs.anl.gov/mpi/mpich/r1_2_2changes.html о полном списке изменений.

Новые возможности, включенные в 1.2.1:

• Улучшенная поддержка различных компиляторов Фортран и Фортран 90. В частности, одна версия mpich может теперь быть построена с использованием нескольких различных компиляторов Фортрана; см. руководство по инсталляции (в doc/install.ps.gz) для пояснений.
• Облегчено использование компилятора С для программ MPI, использующих mpich, являющегося отличным от того, с помощью которого строился mpich; см. руководство по инсталляции.
• Известные проблемы и ошибки данной реализации документированы в `mpich/KnownBugs'.
• Существует раздел ЧаВО (Часто задаваемые ВОпросы) на
  http://www.mcs.anl.gov/mpi/mpich/faq.html. См. сюда, если вы получаете при запуске mpich сообщения вида ``permission denied'', ``connection reset by peer'', ``poll: protocol failure in circuit setup''.
• Статья о jumpshot доступна на ftp://ftp.mcs.anl.gov/pub/mpi/jumpshot.ps.gz.Статья о MPD доступна на ftp://ftp.mcs.anl.gov/pub/mpd.ps.gz.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

Быстрый запуск

1. Если у Вас установлен gunzip, получите ``mpich.tar.gz'', иначе используйте ``mpich.tar.Z'' из http://www.mcs.anl.gov/mpi/mpich/download или по анонимному ftp://ftp.mcs.anl.gov из каталога pub/mpi. (Если этот файл слишком велик, попытайтесь получить его частями из
   pub/mpi/mpisplit и соединить их вместе.)
2. gunzip -c mpich.tar.gz | tar xovf -

   или (при использовании GNU tar)

   tar zxvf mpich.tar.gz

   или (если gzip недоступен)

   zcat mpich.tar.Z | tar xovf -

3. cd mpich-1.2.2
4. ./configure
   Это действие вызовет попытку выбрать подходящую для Вас по умолчанию архитектуру и устройство. Если значения по умолчанию не устраивают Вас, см. разд. 4. Наилучшим является указать каталог для инсталляции и конфигурации mpich в данном каталоге. Пример:

   ./configure -prefix=/usr/local/mpich-1.2.2

5. make >& make.log
   (синтаксис C-shell). Данное действие может продолжаться от 10 мин. до часа или больше в зависимости от загрузки Вашей системы и файлового сервера.
6. (Необязательно) Для сети рабочих станций или при запуске на отдельной машине отредактируйте файл mpich/util/machines/machines.xxx (где xxx является mpich-именем для архитектуры Вашей машины; Вы должны определить его), чтобы отразить локальные имена машин Вашей сети. Если Вы хотите, этот шаг можно опустить, поскольку, по умолчанию здесь уже будет пять копий для машины, на которой построен mpich. На параллельных машинах этот шаг выполнять не требуется. См. `README' в каталоге `mpich/util/machines' для описания формата.
7. (Необязательно) Постройте и запустите простую тестовую программу:

   cd examples/basic
   make cpi
   ../../mpirun -np 4 cpi

   С этого момента вы запустили на вашей системе MPI-программу.

8. (Необязательно) Проведите полный тест по приемке дистрибутива (См. разд. 7 о том, как это делается).
9. (Необязательно) Постройте остальные инструменты MPI: Для устройства ch_p4 использование безопасного сервера (см. разд. 6.1.3) может ускорить запуск задач; Безопасный сервер строится как часть mpich. Программа nupshot является более быстрой версией upshot, но требует исходные коды tk версии 3.6. Если у Вас есть этот пакет, вы можете построить nupshot командой

   make nupshot

10. (Необязательно) Если вы хотите установить mpich в общий раздел, чтобы и другие могли использовать его, используйте

    make install

    или

    bin/mpiinstall

    чтобы установить mpich в каталог, указанный опцией -prefix скрипта configure. Инсталляция будет содержать каталоги `include', `lib', `bin', `sbin', `www' и `man', а также небольшой каталог `examples'. Если Вы хотите удалить инсталляцию, Вы можете запустить скрипт

    sbin/mpiuninstall

11. (Необязательно) С этого момента Вы можете сообщить пользователям, как компилировать и запускать MPI-программы, используя инсталляцию, созданную в /usr/local/mpi (или там, куда Вы его установили). См. разд. 13 о командах, которые могут использовать пользователи. Они также могут копировать Make-файлы из /usr/local/mpi/examples и адаптировать их для собственного пользования.

Получение и распаковка дистрибутива

gunzip -c mpich.tar.gz | tar xovf -

tar zxvf mpich.tar.gz

zcat mpich.tar.Z | tar xovf -

uncompress mpich.tar.Z

tar xvf mpich.tar

COPYRIGHT.

Соглашение о копирайте. Данный программный код является свободно распространяемым, но не бесплатным. Он принадлежит University of Chicago and Missisippi State University.

Makefile.in

Заготовка Make-файла, который будет создан после запуска configure.

MPI-2-C++

Система С++ из Notre Dame. Она включает связывание с С++ для функций MPI-1.

README

Общая информация и инструкции по конфигурации.

aclocal.m4

Используется для построения 'configure' из 'configure.in'; не нужен для большинства инсталляций. Файл aclocal_tcl.m4 включается в aclocal.m4.

ccbugs

Каталог программ, которые тестируют компилятор С во время конфигурации, чтобы убедиться в возможности компиляции системы.

configure

Скрипт, который Вы запускаете для создания Make-файлов системы.

configure.in

Входящий файл autoconf, который создает configure

doc

Различные инструменты создания документации, вместе с руководством по инсталляции и руководством пользователя.

examples

Каталог, содержащий подкаталоги с примерами программ MPI. Следует отметить отдельно basic с несколькими небольшими примерами для первой пробы, test с набором тестов для испытания mpich, и perftest, содержащий код оценки производительности.

include

Библиотека include-файлов, системных и пользовательских.

bin

Содержит программы и исполняемые скрипты, такие как mpicc и mpirun, используемые для построения и запуска программ MPI.

lib

Содержит библиотеки для MPI, mpe и относящихся к ним инструментов.

man

Страницы man для MPI, mpe и внутренних процедур.

mpe

Исходный код расширений mpe для регистрации и графики X Window. Каталог contrib содержит примеры. Лучшими являются подкаталоги mandel и mastermind. Подкаталог профилинга содержит подсистему профилинга, включая систему автоматической генерации "обрамления" для профилирующего интерфейса MPI. mpe также включает программы визуализации производительности, таких как jumpshot (см. разд. 10.2).

mpid

Исходный код различных "устройств", настраивающих mpich на определенную машину, операционную систему и среду.

romio

Система параллельного ввода-вывода ROMIO, включающая реализацию большей части стандарта параллельного ввода-вывода MPI-2.

src

Исходный код переносимой части mpich. Здесь имеются подкаталоги различных частей спецификации MPI.

util

Вспомогательные программы и файлы.

www

Версия HTML для страниц man.

Документация

Конфигурирование mpich

Конфигурация mpich выполняется скриптом configure, находящимся в каталоге верхнего уровня. Этот скрипт автоматически создается с помощью программы GNU autoconf (Версия 1.6, но не версия 2) из файла configure.in, но Вам не обязательно необходим autoconf.

Скрипт configure сам по себе достаточно документирован. Если Вы наберете

configure -usage

prefix=dir

Префикс инсталляции. configure понимает все обычные аргументы инсталляционных каталогов GNU, включая libdir и mandir. Мы рекомендуем всем пользователям определять каталог инсталляции через prefix.

with-device=name

Устанавливает имя используемого устройства для mpich. devname должно быть именем одного из каталогов в каталоге `mpid', например ch_p4, ch_shmem, globus2 ,ch_p4mpd.

with-comm=name

Выбирает опцию коммуникации для устройства. Сейчас используется только для
устройства ch_p4; поддерживаются значения shared (для узлов SMP) и bproc (для Scyld).

enable-debug

Включает поддержку отладчика TotalView©. Это позволит TotalView показывать информацию об очередях сообщений.

enable-sharedlib

Создает и статические, и разделяемые библиотеки для mpich. Это поддерживается только несколькими системами, включая те, которые используют gcc (например, большинство систем Linux Beowulf).

-automountfix=program

Это иногда необходимо для систем с проблемами автомонтирования (см. разд. 6.1.2).

-rsh=commandname

Устанавливает имя программы для запуска удаленных процессов. Это используется только устройством ch_p4, и если имя не указано, то configure пробует определить подходящую программу.

Кроме того, configure использует переменные окружения, такие,как MAKE, CC, F77, CFLAGS,
FFLAGS.

Обычно рекомендуется использовать configure с наименьшим числом аргументов. Если вы опустите все аргументы, configure обычно догадается о правильной архитектуре (arch), если Вы не работаете в кросс-платформенной среде, и также выберет подходящее устройство (device). Если подходящим механизмом коммуникации является TCP/IP, по умолчанию выбирается устройство TCP (ch_p4).

mpich реализован с использованием спецификации абстрактного устройства (ADI), описанной в [6]. В некоторых системах это абстрактное устройство сконфигурировано, чтобы стать стандартной коммуникационной подсистемой машины. Это можно выполнить, задав аргумент with-device для configure. Для остальных систем, общее коммуникационное устройство создается с использованием p4 [1,2] и используется как реализация ADI. В этих случаях используйте в качестве устройства ch_p4.

ARCH_TYPE определяет, для какого типа процессора производится компиляция. Возможные значения были приведены выше. Для IBM SP тип архитектуры rs6000. Если опция не задана, configure попытается определить тип.

Некоторые машины имеют множество коммуникационных опций, определяемых аргументом comm. В настоящее время устройство ch_p4 использует их. Выбирая -comm=shared, Вы создаете версию устройства ch_p4, которое допускает использование разделяемой памяти и IP/TCP. Это используется в частности на кластерах симметричных мультипроцессорных систем.

Новое устройство globus2 [3,5], основанное на системе исполнения Globus [4], также доступно. Как и устройство ch_p4, устройство Globus способно использовать коммуникацию многими методами на некоторых платформах. Например, IBM SP могут общаться через IBM MPI или TCP в зависимости от узлов, которые связываются. За деталями обращайтесь на http://www.globus.org.

Некоторые примерные вызовы configure показаны ниже. В большинстве случаев создаются также и библиотеки mpe (см. разд. 9 для подробной информации об инсталляции mpe и руководство пользователя mpich для подробной информации об использовании возможностей mpe). Для сборки без библиотек mpe используйте опцию -without-mpe. В большинстве случаев детальные вызовы, указанные ниже, являются вызовами по умолчанию, т.е. тем, что Вы получите, вызвав configure без аргументов. Поэтому наилучшей общей стратегией будет вначале попробовать

./configure

• Конфигурирование mpich для работы с различными компиляторами.
• Рабочие станции в общем.
• Сети рабочих станций с устройством ch_p4
• Сети рабочих станций с устройством ch_p4mpd.
• Вычислительные решетки с устройством globus2
• Процессоры массового параллелизма и большие многопроцессорные системы
• Построение mpich
• Подготовка mpich для отладки в TotalView
• Фортран
  • Что делать, если нет компилятора Фортрана?
  • Фортран 90
  • Фортран 77 и Фортран 90
  • Модули Фортран 90
  • Конфигурирование для компилятора Absoft Fortran
  • Конфигурирование для множества компиляторов Фортрана
  
  
• Специальные выпуски для гетерогенных сетей и устройства ch_p4
• Настройка rsh
• Конфигурация с помощью ssh
• mpich и потоки
• Процедуры MPI и PMPI

Конфигурирование mpich для работы с различными компиляторами.

К сожалению, это не всегда работает. Например, в некоторых случаях, различным компиляторам могут потребоваться различные библиотеки при компоновке программ. Некоторые компиляторы требуют дополнительных опций для поддержки ANSI/ISO C. В частности, поддержка длинных типов данных, таких как long long или long double может зависеть от библиотек времени выполнения, которые специфичны для каждого компилятора. Чтобы обработать все такие случаи для C и C++, Вы можете создать файл с именем `mpicc-<compilename>.conf', т.е. `mpicc-gcc.conf' или `mpicc-pgcc.conf', который содержит все определения, необходимые команде mpicc. mpiCC использует `mpiCC-<compilename>.conf'. Сейчас эти файлы нужно создавать вручную, начав с файла `mpichlib.conf', который создается скриптом configure для mpich в каталоге `mpich/util'. Простейшим способом создания файлов является использование configure:

setenv CC cc
configure prefix=/usr/local/mpich-1.2.2
make
make install
cp util/mpichlib.conf /usr/local/mpich-1.2.2/etc/mpicc-cc.conf

setenv CC gcc
configure prefix=/usr/local/mpich-1.2.2
make
cp util/mpichlib.conf /usr/local/mpich-1.2.2/etc/mpicc-gcc.conf

В этом примере использованы значения по умолчанию для sysconfdir, $prefix/etc.

Например, если mpich использует в качестве компилятора cc, а пользователь ожидает вместо
этого gcc, команда MPICH_CC=gcc

mpicc ...

mpicc -config=gcc ...

Рабочие станции в общем.

mpich может запускаться на гетерогенных сетях рабочих станций различных типов. Для простого набора рабочих станций можно использовать команду mpirun; более сложные наборы гетерогенных машин требуют наличия файла `procgroup' для p4 (для устройства ch_p4) или файла `RSL' (для устройства globus2). Формат файла `procgroup' описан в разделе 6.1. Формат файла `RSL' можно найти в документации Globus по адресу http://www.globus.org под названием Resource Specification Language (Язык Описания Ресурсов).

Устройство ch_p4 используется наиболее просто, когда все рабочие станции разделяют общую файловую систему. Исполняемые файлы MPI должны размещаться на разделяемой файловой системе. Однако, такая система не необходима. С использованием файла `procgroup' размещение исполняемых файлов на каждой рабочей станции может быть определено в различных местах.

Compaq Alpha

Если все Ваши рабочие станции производства Compaq, Вы можете использовать собственный MPI Compaq. Если вы используете mpich, то для получения всех преимуществ ANSI C Вам нужно добавить -cflags=``-std''. Для строгого ANSI C используйте -cflags=``-std1''.

HP

Если все Ваши рабочие станции производства Compaq, Вы можете использовать собственный MPI для HP. Если Вы используете mpich, не требуется никаких дополнительных шагов.

IBM RS6000

Чтобы получить все преимущества ANSI C, Вам необходимо добавить
-cflags=``-qlanglvl=ansi''. В настоящее время mpich не тестировался в 64-битном режиме на рабочих станциях RS6000; предыдущие версии mpich, использующие устройства ch_mpl или ch_p4, имели проблемы с 64-битным AIX (mpich работает с другими 64-битными операционными системами³).

SGI

configure

Некоторые системы SGI поддерживают как 32-х, так и 64-хбитные указатели (адреса). Mpich использует архитектуру IRIX для ссылок на 32-хбитные системы и IRIX64 - для ссылки на 64-хбитные. Mpich пытается определить подходящую архитектуру автоматически, но Вы можете ускорить выбор, определив архитектуру опцией with-arch=IRIX, with-arch=IRIX32,
with-arch=IRIXN32, with-arch=IRIX64. Последние три из них соответствуют опциям компилятора SGI -32, -n32, -64. Убедитесь в том, что флаги к компилятору и компоновщику присоединяются через переменные окружения следующим образом

setenv CC ``cc -64''
setenv FC ``f77 -64''
configure ...

Sun

Если все Ваши рабочие станции производства Sun, Вы можете использовать собственный MPI от Sun. Если Вы используете mpich, не требуется никаких дополнительных шагов.

Сети рабочих станций с устройством ch_p4

Linux

Устройство ch_p4 должно быть выбрано по умолчанию. Использование разделяемой памяти с опцией -comm=shared поддерживается с версии 1.2.0 через IPC системы Unix. Использование mmap не поддерживается, поскольку LINUX не поддерживает использование MAP_SHARED и MAP_ANONYMOUS. Поскольку System V IPC не могут (из-за проектирования) надежно освобождаться приложением после окончания их использования, Вы можете использовать команду cleanipcs, представленную в mpich.

FreeBSD

Для сети ПК, работающих под FreeBSD версией Unix:

configure with-device=ch_p4 with-arch=freebsd

SGI

(Многопроцессорные системы, такие, как Onyx и Origin 2000), использующие разделяемую память для быстрого прохождения сообщений

configure with-device=ch_p4 -comm=shared

Используйте -arch=IRIX, чтобы установить 32-хбитные указатели и -arch=IRIX64, чтобы установить 64-хбитные указатели.

Sun SunOS

configure with-device=ch_p4 with-arch=sun4

Mpich уже требует компилятора, поддерживающего прототипы ANSI C. Старый компилятор C, привязанный к SunOS, не поддерживает прототипы. Если Вам необходим компилятор с поддержкой прототипов, мы рекомендуем использовать GNU C компилятор (gcc).

Sun Solaris

configure with-device=ch_p4 with-arch=solaris

Compaq Alpha

configure with-device=ch_p4 with-arch=alpha

Fujitsu

Для сети Fujitsu M780s под управлением UXP/M были протестированы следующие опции:

setenv FC frt
configure with-arch=UXPM with-device=ch_p4
-fflags=``-Oe, -Uep -Eml -Aabe''
-mpe -mpedbg -prefix=/usr/local/mpi
-tcldir=/usr/local -tkdir=/usr/local -wish=/usr/local/bin/wish

HP HPUX

Для сети рабочих станций HP, включая библиотеку mpe, но исключив из нее графические процедуры X Window:

configure with-device=ch_p4 -arch=hpux -mpe -no_mpegraphics

Сети рабочих станций с устройством ch_p4mpd.

Вычислительные решетки с устройством globus2

setenv GLOBUS_INSTALL_PATH /usr/local/globus

При конфигурации устройства globus2 вы можете установить одну из ``изюминок'' Globus (т.е. mpi, debug или nodebug, threads, 32- или 64-bit и т.д.). Чтобы увидеть полный список всех ``изюминок'' Globus (поскольку не все из них могут быть установлены на Вашей машине), используйте команду

$GLOBUS_INSTALL_PATH/bin/globus-development-path -help

``Изюминки'', доступные Вам (установленные на Вашей машине) перечисляются как каталоги в
$GLOBUS_INSTALL_PATH/development. Например, инсталяция Globus на рабочей станцией под управлением Solaris может иметь следующие ``изюминки'' :

sparc-sun-solaris2.7_nothreads_standard_debug/
sparc-sun-solaris2.7_pthreads_standard_debug/
sparc-sun-solaris2.7_solaristhreads_standard_debug/

Существует два метода конфигурации устройства globus2. Каждый метод выбирает один из каталогов ``изюминок'' Globus в $GLOBUS_INSTALL_PATH/development. Первый метод состоит в точном указании каталога ``изюминки'', например:

configure with-device=globus2:
-dir=$GLOBUS_INSTALL_PATH/development/sparc-sun-solaris 2.7_nothreads_standard_debug

Вы можете также указать каталог ``изюминки''неявно

configure with-device=globus2:-flavor=nothreads,debug

Наконец, вы можете просто выбрать ``изюминки'' по умолчанию (полученные от
$GLOBUS_INSTALL_PATH/bin/globus-development-path)

configure -device=globus2

Вы должны определить -mpi, чтобы разрешить поддерживаемые поставщиком MPI-взаимодействия для внутримашинных сообщений. Другими словами, при конфигурировании на машинах, которые предоставляют собственную реализацию стандарта MPI, Вы должны определить -mpi для лучшей производительности. Неупоминание -mpi отразится на внутримашинных связях TCP.

Выбор -debug может быть полезным в процессе отладки, но замедляет производительность. -nodebug нужно использовать для отлаженного кода продукта.

В общем, необходимо использовать -nothreads (устройство Globus2 не многопоточное). Вам необходимо выбирать поддержку потоков, только если Вы планируете связать Ваше MPI-приложение с другими модулями, которые потребуют версию Globus с поддержкой потоков (т.е. Вы напишете библиотеку, использующую Nexus, который требует наличие обработчиков потоков). Вы не должны выбирать поточную версию Globus лишь потому, что Ваше MPI-приложение многопоточное. Когда Globus создан, автоматически генерируется специальный Make-файл для mpich. Configure использует этот файл для конфигурирования устройства globus2. Этот специальный Make-файл содержит практически всю информацию, необходимую configure для mpich (включая пути к каталогам, специальные библиотеки, имена компиляторов и компоновщиков C и Фортрана, и т.д.).

Процессоры массового параллелизма и большие многопроцессорные системы

Многопроцессорные системы Cray

(не CRAY T3D, а например, 4-хпроцессорный Cray YMP или С90)

configure with-device=ch_p4 with-arch=CRAY

HP Exemplar

Для этой системы возьмите, пожалуйста, официальную версию HP (ранее называлась Convex). Она основана на mpich, но настроена для обеспечения лучшей производительности
в Exemplar. Если по некоторым причинам Вы хотите использовать на HP версию mpich с разделяемой памятью, используйте команду

configure with-device=ch_shmem with-arch=hpux

IBM SP

(использует высокопроизводительный переключатель для коммуникации)

configure with-device=ch_mpl with-arch=rs6000

Заметьте, что это требует поддержки для библиотеки передачи сообщений IBM MPL. Некоторые из последних версий программного обеспечения IBM SP могут не включать поддержку этой устаревшей библиотеки. В этом случае, Вы должны использовать реализацию IBM MPI.

Многопроцессорные SGI

такие как Origin 2000. Собственный MPI от SGI хорошо настроен на эти машины. Если Вы хотите использовать mpich, используйте команду

configure with-device=ch_shmem

Configure попытается определить количество доступных процессоров; Вы можете переопределить значение установкой переменной окружения PROCESSOR_COUNT перед запуском configure. С другой стороны, Вы можете отредактировать файл `mpich/mpid/ch_shmem/shdef.h' для регулирования максимального числа процессоров и памяти, которая используется для передачи сообщений через разделяемую память. Если Вам нужно сгенерировать определенную версию, соответствующую опциям 32, - n32, -64 компилятора SGI, используйте архитектуры IRIX32, IRIXN32, IRIX64 вместо SGI. Следующее используйте специально для SGI R10000 или R12000:

./configure -arch=IRIX32
./configure -arch=IRIXN32
./configure -arch=IRIX64

Если необходимо определить специальные опции компилятора, они могут быть установлены переменными окружения CC и FC:

setenv CC ``cc -32''
setenv FC ``f77 -32''
configure with-arch=IRIX32
-opt=``-O2''
with-device=ch_shmem

setenv CC ``cc -n32 -mips4 -r10000''
setenv FC ``f77 -n32 -mips4 -r10000''
configure with-arch=IRIXN32
-opt=``-O2''
with-device=ch_shmem

setenv CC ``cc -64 -mips4 -r10000''
setenv FC ``f77 -64 -mips4 -r10000''
configure with-arch=IRIX64
-opt=``-O2''
with-device=ch_shmem

(Уровень оптимизации необязателен; -O2 работает для некоторых пользователей. Будьте внимательны к чересчур строгой оптимизации, особенно в коде `mpid/ch_shmem').

См. комментарии для рабочих станций SGI для различных 32-х- и 64-хбитных опций.

NEC SX-4

Для векторных мультипроцессоров с разделяемой памятью NEC SX-4 используйте команду

configure with-device=ch_lfshmem

чтобы получить свободное от блокировок устройство с разделяемой памятью, описанное в [9]. Заметьте, что это устройство требует специального ассемблерного кода или опций компилятора, чтобы работать надежно.

Построение mpich

-opt=-O -disable-devdebug

-opt=``-O -qarch=pwr2''

Подготовка mpich для отладки в TotalView

enable-debug

Фортран

• Что делать, если нет компилятора Фортрана?
• Фортран 90
• Фортран 77 и Фортран 90
• Модули Фортран 90
• Конфигурирование для компилятора Absoft Fortran
• Конфигурирование для множества компиляторов Фортрана

Что делать, если нет компилятора Фортрана?

Фортран 90

Фортран 77 и Фортран 90

setenv FC f90
setenv F90 f90
configure

setenv FC f77
configure disable-f90 -prefix=/usr/local/mpich-1.2/f77-nof90
make
make install
setenv FC f90
setenv F90 f90
configure -prefix=/usr/local/mpich-1.2/f90
make
make install

Модули Фортран 90

Два различных модуля могут быть доступны через опцию -nochoice и -choice для mpif90 (скрипт для компиляции и компоновки программ MPI). Версия choice поддерживает ограниченное число типов данных (числовые скаляры и числовые одно- и двумерные массивы). Это экспериментальная возможность; пожалуйста, присылайте почту на mpi-bugs@mcs.anl.gov при любых проблемах.

Причина наличия двух версий модуля MPI состоит в трудности создания полностью корректного модуля, включающего все функции с аргументами ``по выбору''. На многих системах размер модуля Фортран 90 для работы с процедурами, имеющими аргументы ``по выбору'' больше, чем вся версия С библиотеки MPI. Если Вас не интересует модуль MPI для Фортрана 90, или Вы хотите иметь небольшую версию mpich, Вы можете отключить создание модуля MPI для Фортрана 90 опцией disable- f90modules.

Конфигурирование для компилятора Absoft Fortran

В дополнение к этому, Вам необходимо использовать -N90, если Вы используете символьные данные, поскольку интерфейс Фортрана для mpich предполагает соглашение о вызовах, которым пользуются практически все системы Unix Fortran (отдельно обсуждается Cray UNICOS). Если Вы создаете разделяемые библиотеки, Вам также необходимо установить переменную окружения FC_SHARED_OPT в none.

Ранние версии компилятора Absoft не могли обрабатывать множественные опции -I. Если у Вас с этим возникают проблемы, обратитесь за дополнением к Absoft.

Конфигурирование для множества компиляторов Фортрана

Первым этапом является конфигурация mpich с опцией with-flibname. Например, если один из компиляторов - это g77, используйте

setenv F77 g77 ./configure with-flibname=mpich-g77 ... other options ...

1. Перейдите в каталог `src/fortran'
2. Выполните

   setenv F77 pgf77
   ./configure with-mpichconfig with-flibname=mpich-pgf77
   make
   make install-alt

Специальные выпуски для гетерогенных сетей и устройства ch_p4

no_short_longs

Настройка rsh

Следующая информация поясняет настройку отдельной машины, чтобы на ней можно было использовать rsh для запуска процессов. Для установки rsh Вам необходимо убедиться в наличии файла
`/etc/hosts.equiv', который содержит как минимум

localhost your_machine_name

Вы должны также убедиться в том, что файлы `/etc/hosts.allow' и `/etc/hosts.deny' пустые.

При использовании машины, не подключенной к сети, например, ноутбука при путешествиях, Вам может понадобиться сменить установки сети. В некоторых версиях Linux можно использовать netcfg и установить Hostname в localhost и Domain в localdomain.

Конфигурация с помощью ssh

Ниже приведен ряд шагов, которые необходимо осуществить, чтобы ssh корректно работала с mpich.

1. Убедитесь, что в Вашей системе установлена ssh (команда which ssh). Если ее нет, Вы можете взять ее по адресу http://www.ssh.fi/sshprotocols2/index.html.
2. Создайте свой ключ авторизации.

   ssh-keygen

   Это действие приведет к генерации пары личного и общего ключа. Личный ключ будет сохранен в

    /.ssh/identity

   а общий ключ будет сохранен в

    /.ssh/identity.pub

3. Авторизация доступа. Поместите Ваш общий ключ в файл  /.ssh/authorized_keys. Все ключи, упомянутые в этом файле, будут позволять доступ.

   cp /.ssh/identity.pub /.ssh/authorized_keys

   Если машина, на которой Вы соединяетесь, не разделяет общую файловую систему, то
    /.ssh/identity.pub нужно скопировать поверх  /.ssh/authorized_keys той машины, к которой Вы подключаетесь. ssh необходимо, чтобы authorized_keys не имел разрешения на запись для группы, так что сделайте

   chmod go-rwx  /.ssh/authorized_keys

   Этот шаг позволит Вам не вводить пароль каждый раз при запуске команды безопасного shell.
4. Чтобы избежать ввода пароля всякий раз, когда вызывается ssh, необходимо создать ssh-agent и добавить к нему пароль.

   ssh-agent $SHELL
   ssh-add

5. Выполните конфигурирование с -rsh=ssh, чтобы устройство ch_p4 использовало ssh вместо rsh:

   configure -rsh=ssh

• Убедитесь, что машины, перечисленные в Вашем util/machines/machine.xxxx также присутствуют в файле /etc/ssh_known_hosts Вашей сети или в  /.ssh/known_hosts в Вашем домашнем каталоге.
• Важно, чтобы /tmp имел права доступа 377, владельца - root и группу 0.
• openssh имеет флаг -v, очень полезный для отслеживания проблем установки связи.

mpich и потоки

with-device=ch_p4

./configure with-device=ch_p4:-listenersig=SIGUSR2
make

Процедуры MPI и PMPI

disable-weak-symbols

configure disable-weak-symbols ...

disable-weak-symbols

Компиляция mpich

make

make >& make.log &

После запуска make размер дистрибутива будет около 45 мегабайт (в зависимости от конкретной машины, на которой происходит компиляция и выбранных опций), прежде чем будут созданы любые примеры или дополнительная тестовая библиотека. Make-файлы для различных тестовых подкаталогов уже созданы, но сами примеры программ должны быть собраны "вручную".

• С++
• Построение для множества устройств или архитектур

С++

Построение для множества устройств или архитектур

./configure with-device=ch_p4
-prefix=/usr/local/mpich-1.2.2/solaris/ch_p4
make >& make.log
make install
./configure with-device=ch_shmem
-prefix=/usr/local/mpich-1.2.2/solaris/ch_shmem
make >& make.log
make install

Запуск программ MPI

set path= ($path /home/me/mpich/bin)

Некоторые простые MPI-программы расположены в каталоге mpich/examples/basic и содержат программы на С и Фортране для оценки числа . Перейдите в этот каталог и выполните (предполагая, что Вы добавили каталог с mpirun в Ваш путь)

make cpi
mpirun -np 4 cpi

make fpi
mpirun -np 4 fpi

make systest
mpirun -np 2 systest

• Специальные дополнения о запуске в сети рабочих станций
  • Использование устройства ch_p4
  • Действия при автомонтировании.
  • Скорейший запуск задач для устройства ch_p4
  • Остановка серверов P4
  • Управление серверами
  
  
• Использование демонов MPD для устройства ch_p4mpd
  • Инсталляция
  • Запуск и управление демонами MPD
  
  
• Специальные дополнения о запуске в разделяемой памяти
• NFS и MPI-IO

Специальные дополнения о запуске в сети рабочих станций

• Использование устройства ch_p4
• Действия при автомонтировании.
• Скорейший запуск задач для устройства ch_p4
• Остановка серверов P4
• Управление серверами

Использование устройства ch_p4

mercury
venus
earth
mars
earth
mars

mercury.my.edu
venus.my.edu
earth.my.edu
mars.my.edu
earth.my.edu
mars.my.edu

mercury
venus
earth
mars:2
earth
mars:2

Действия при автомонтировании.

Чтобы справиться с этой проблемой, configure позволяет Вам определить программу-фильтр, если Вы выполните ее с опцией -automountfix=PROGRAM, где PROGRAM - это фильтр, читающий путь к файлу из стандартного ввода, делающий необходимые изменения и записывающий результат в стандартный вывод. mpirun использует эту программу, чтобы найти необходимые ему файлы. По определению значением PROGRAM является

sed -e s@/tmp_mnt/@/@g

В качестве другого примера некоторые системы генерируют пути в виде

/a/thishost/root/home/username/....

/u/home/username/....

-automountfix=`sed -e s@/a/./home@/u/home@g'

Скорейший запуск задач для устройства ch_p4

1. Выберите порт. Это номер, который Вы используете для идентификации безопасного сервера (различные номера портов могут использоваться для одновременной работы нескольких безопасных серверов). Хорошим выбором будет номер больше 1000. Если Вы выберете номер, который уже используется, сервер закончит работу, и Вам будет необходимо выбрать другой номер. На многих системах Вы можете использовать команду rpcinfo, чтобы узнать, какие номера портов используются (или зарезервированы). Например, чтобы определить используемые порты на машине mysun, попробуйте

   rpcinfo -p mysun

2. Запустите безопасный сервер. Для этого служит скрипт `sbin/chp4_servs'

   sbin/chp4_servs -port=n -arch=$ARCH

   Он позволяет запускать сервер через удаленный shell (rsh, remsh или ssh); если Вы не можете использовать удаленный shell, Вам необходимо зарегестрироваться в каждой системе,на которой Вы хотите запустить безопасный сервер и делать это вручную. Команда для запуска индивидуального сервера с использованием порта 2345

   serv_p4 -o -p 2345 &

   К примеру, если Вы выбрали порт 2345 и работаете в Solaris, Вы должны дать команду

   sbin/chp4_servs -port=2345 with-arch=solaris

   Сервер создает протокол своих действий в файле `Secure_Server.Log.xxxx' в текущем каталоге, где xxxx - идентификатор процесса, запустившего сервер (заметьте, что сервер может быть запущен как потомок этого начального процесса).
3. Чтобы пользоваться безопасным сервером для устройства ch_p4, Вы должны информировать mpirun о номере порта. Вы можете сделать это двумя способами. Первый - это указать mpirun опцию -p4ssport n. Например, если порт имеет номер 2345 и Вы хотите запустить cpi на четырех процессорах, используйте

   mpirun -np 4 -p4ssport 2345 cpi

   Другим способом информирования mpirun о безопасном сервере является использование переменных окружения MPI_USEP4SSPORT и MPI_P4SSPORT. В С shell Вы можете установить их так

   setenv MPI_USEP4SSPORT yes
   setenv MPI_P4SSPORT 2345

   Значение MPI_P4SSPORT должно быть портом, на котором Вы запускаете безопасные серверы. Если эти переменные окружения установлены, никаких опций для mpirun больше не нужно.

Остановка серверов P4

ptfps -all -tn serv_p4 -and -o $LOGNAME -kill INT

ps auxww | egrep ``$LOGNAME.*serv_p4''

ps -flu $LOGNAME | egrep `serv_p4'

Альтернативный подход обсуждается в разд. 6.1.5.

Управление серверами

Прежде чем использовать этот скрипт, Вам нужно отредактировать его; проверить, что в нем заданы верные значения для serv_p4, portnum и machinelist; Вам также может понадобиться установить первую строку на Вашу версию perl5.

Для проверки состояния Ваших серверов используйте

chkserv -port 2345

chkserv -port 2345 -restart

chkserv -port 2345 -kill

Это программное обеспечение - экспериментальное. Если у Вас есть комментарии или предложения, пожалуйста, присылайте их на mpi-bugs@mcs.anl.gov.

Использование демонов MPD для устройства ch_p4mpd

• Инсталляция
• Запуск и управление демонами MPD

Инсталляция

configure with-device=ch_p4mpd -prefix=<installdir> <other options>

Если Вы намерены запускать демонов MPD как root, Вы должны также выполнять конфигурирование с enable-root. Тогда многие пользователи могут использовать для запуска задач один и тот же набор демонов MPD. После конфигурирования, как обычно

make
make install

Запуск и управление демонами MPD

with-device=ch_p4mpd -prefix=<prefix directory> <other options>

mpichboot <file> <num>

mpd идентифицируется по имени машины и порту. Для управления кольцом mpd используется ряд команд:

mpdhelp

Выводит эту информацию

mpdcleanup

Удалает файлы сокетов Unix `/tmp/mpd.*', если это необходимо

mpdtrace

Заставляет каждый mpd в кольце ответить сообщением, идентифицирующим его самого и его соседей.

mpdringtest count

Посылает сообщение по кольцу ``count'' раз и отмечает время

mpdshutdown mpd_id

Останавливает указанный mpd; mpd_id задается как host_portnum.

mpdallexit

Вызывает завершение всех mpd.

mpdlistjobs

Показывает активные задания, управляемые кольцом mpd.

mpdkilljob job_id

Завершает указанную задачу.

-h

<имя машины для соединения>

-p

<номер порта для соединения>

-c

разрешить консоль (по умолчанию)

-n

не разрешать консоль

-d

<отладка (0 или 1)>

-w

<рабочий каталог>

-l

<порт для прослушивания>

-b

фоновое приложение-демонизация

-e

не позволять этому mpd запускать процессы, если пользователь не root

-t

выводить номер порта для прослушивания при запуске

Специальные дополнения о запуске в разделяемой памяти

bin/cleanipcs

NFS и MPI-IO

MPI_Barrier: Internal MPI error: No such file or directory
File locking messages

MPI_Barrier: Внутренняя ошибка MPI: Файл или каталог не найден
Сообщения о блокировке файла

1. Убедитесь, что Вы работаете с nfs версии 3

   rpcinfo -p `hostname' | grep nfs

   к примеру, во втором столбце должна быть `3'

   fire> rpcinfo -p fire | grep nfs
   100003     3     udp     2049     nfs

2. Отредактируйте `/etc/fstab' для каждого каталога nfs, доступного по записи и чтению MPI-IO на каждой машине, используемой для multihost MPI-IO. Ниже приведен пример правильной строки fstab для /epm1:

   root> grep epm1 /etc/fstab
   gershwin:/epm1 /rmt/gershwin/epm1 nfs bg,intr,noac 0 0

   Если отсутствует опция `noac', добавьте ее и смонтируйте заново этот каталог на каждой машине, которая будет использована для разделения файлов MPI-IO.

   root> umount /rmt/gershwin/epm1
   root> mount /rmt/gershwin/epm1

3. Убедитесь, что каталог смонтирован с опцией noac

   root> grep gershwin /etc/mnttab
   gershwin:/epm1 /rmt/gershwin/epm1 nfs
   noac, acregmin=0, acregmax=0,acdirmin=0, acdirmax=0 0 0 899911504

Процесс тестирования

make testing

make clean

make testing

Если у Вас возникли проблемы, сначала ознакомьтесь с руководством по исправлению ошибок и списками известных проблем. Если Вам все еще нужна помощь, отошлите детальную информацию на mpi-bugs@mcs.anl.gov.

Инсталляция mpich для коллективного использования

make install

Существует возможность определить каталог, в который mpich будет установлен после создания, установив значение PREFIX при выполнении этапа инсталляции:

make install PREFIX=/usr/local/mpich-1.2.2

Хорошим способом обращаться с различными реализациями mpich является установка их в каталоги, имена которых включают номер версии, и настройка связи из mpi в этот каталог. Например, если текущая версия 1.2.2, командами для инсталляции в `/usr/local' будут

make install PREFIX=/usr/local/mpi-1.2.2
rm /usr/local/mpi
ln -s /usr/local/mpi-1.2.2 /usr/local/mpi

Скрипт `bin/mpiinstall' предлагает больше контроля над процессом инсталляции mpich (на самом деле, make install просто запускает этот скрипт). Например, Вы можете снять защиту с файлов, инсталлируемых с опцией -mode=nnnn (для обычных файлов) и -xmode=nnnn (для исполняемых и каталогов). Вы можете определить каталог, в который будут помещены страницы man опцией -manpath=<path>. Опция -help показывает весь набор опций mpiinstall.

Инсталляция nupshot может иногда быть трудоемкой. Вы можете использовать ключ -nonupshot в mpiinstall, чтобы не устанавливать nupshot; с другой стороны, Вы можете использовать ключ
-cpnupshot для установки копии в `mpich/profiling/nupshot'. Обычно mpiinstall содает новую версию nupshot, чтобы быть уверенным в том, что все пути верны (nupshot должен найти файлы там, где он установлен). Если Вам необходимо построить nupshot ``вручную'' для инсталляции, ключ -cpnupshot позволяет Вам инсталлировать эту версию.

Вы можете протестировать инсталляцию, используя configure в каталоге `mpich/examples/test'. Например, если Вы установили mpich в `/usr/local/mpich' для архитектуры solaris и устройства ch_p4, выполните

cd examples/test
./configure -mpichpath=/usr/local/mpich-1.2.2/solaris/ch_p4/bin
make testing

• Команды пользователя
• Установка документации
  • Страницы man
  • Примеры

Команды пользователя

-prefix=/usr/local/mpich-1.2.2/solaris/ch_p4 и

-prefix=/usr/local/mpich-1.2.2/solaris/ch_shmem.

Установка документации

• Страницы man
• Примеры

Страницы man

Примеры

Библиотека MPE

• Опции конфигурации
• Инструкции по инсталляции mpe
  • Конфигурирование библиотеки mpe как части процесса конфигурации и построения mpich
  • Конфигурирование библиотеки mpe как части существующей реализации MPI
  
  
• Примеры программ mpe
• mpeinstall

Опции конфигурации

1. Опции реализации MPI (обязательны)
2. Общие флаги configure (обязательные/необязательные)
3. Пользовательские опции (необязательны)

Выполнив

./configure help

with-mpich=DIR

Определяет каталог верхнего уровня, в который установлен mpich (версия 1.0.13 или старше)

with-mpichdev=subdir

Определяет подкаталог архитектуры или устройства, которое Вы хотите использовать

with-lam=DIR

Определяет каталог верхнего уровня, в котором установлен LAM MPI

with-sp

Определяет использование собственной реализации IBM POE/MPI

with-sgi

Определяет использование собственной реализации SGI MPI

with-sgi64

Определяет использование собственной реализации SGI MPI, заставляя ее компилироваться в 64-битном режиме

with-cray

Определяет использование собственной реализации Cray MPI

Если Вы хотите конфигурировать mpe для использования с реализацией MPI, не указанной здесь, Вы можете посмотреть, как `configure.in' в каталоге mpe определяет, какие компиляторы, библиотеки и т.д. используются для указанных выше реализациях MPI. Вы можете затем добавить раздел для Вашей собственной реализации MPI в `configure.in'. Убедитесь, что Вы выполнили

autoconf

Другой опцией является использование общих ключей MPI, позволяющих Вам определить собственные каталоги include и lib для MPI.

Общие ключи реализации MPI:

with-mpiinc=MPI_INC

Определяет каталог include для MPI, например

- I/pkgs/MPI/include

with-mpilibs=MPI_LIBS

Определяет библиотеки для профилинга и библиотеки MPI - например,

-L$MPI_LIB_DIR -lfmpich -lpmpich -lmpich

Следующая информация не является полным списком, а некоторыми наиболее общими флагами:

-prefix=DIR

Определяет инсталляционный каталог назначения для скрипта `mpeinstall'. При конфигурировании mpich, это может быть тот же самый каталог, что и заданный в опциях configure для mpich или к скрипту `mpiinstall' в каталоге `mpich/util'. Если эта опция опущена, и -prefix задан как опция к configure для mpich, то этот каталог конфигурируется автоматически. Скрипт `mpeinstall' инсталлирует в каталог DIR только необходимые библиотеки и файлы include, а также небольшое подмножество примеров. (См. разд. 9.4)

-libdir=DIR

Определяет каталог верхнего уровня, куда будут установлены библиотеки mpe. Если этот каталог не существует, он будет создан. Этот флаг обязателен, если mpich не используется и безразличен при использовании mpich (-libdir заменяется -mpichdev).

-bindir=DIR

Это важно, только если Вы устанавливаете jumpshot вместе с библиотекой mpe. Этот каталог передается configure для jumpshot и станет каталогом, в который устанавливаются исполняемые файлы jumpshot. При конфигурировании mpich он автоматически конфигурируется для Вас. В обратном случае, если этот флаг опущен, это будет каталог `libdir/../bin'. Если этот каталог не существует, он будет создан.

x-includes=DIR

Это необязательный флаг, определяющий, что include-файлы для X Window находятся в каталоге DIR. Если он опущен, configure для mpe попытается найти их.

x-libraries=DIR

Это необязательный флаг, определяющий, что библиотечные файлы для X Window находятся в каталоге DIR. Если он опущен, configure для mpe попытается найти их.

Опции пользователя:

enable-echo

Включает полное отображение сообщений. По умолчанию enable=no.

enable-mpe_graphics

Этот ключ позволяет создать графические процедуры для mpe. Если он выключен, то процедуры mpe, использующие графику X11, создаваться не будут. Это подходит для систем, в которых либо отсутствуют include-файлы для X11, либо не поддерживается графика X11. По умолчанию enable=yes.

enable-f77

Этот ключ разрешает компиляцию процедур, требующих компилятора Фортрана. При конфигурировании mpich скрипт configure в каталоге верхнего уровня mpich выберет подходящее значение для Вас. Однако оно может быть переопределено. По умолчанию enable=yes.

enable-debug

Эта опция включает флаги отладочных и диагностических сообщений в коде mpe и SLOG-API. По умолчанию enable=no.

enable-jumpshot

Этот ключ позволяет сконфигурировать графический инструмент jumpshot. По
умолчанию enable=yes. Если эта опция включена и Вы не использовали конфигурирование mpich, Вам необходимо также определить каталог, в который будет установлен jumpshot
(with-jumpshot_home).

enable-buildingmpi.

Этот ключ указывает, что mpe будет строиться как часть большой инсталляции mpich. Он выключает проверку на существование библиотек MPI. Этот ключ не обязателен.

with-tcldir=TCL_DIR

Этот ключ указывает, что tcl находится в каталоге TCL_DIR. Это может быть только версия 7 и в каталоге TCL_DIR должны быть `lib/libtcl.a' и `include/tcl.h'. Только эти файлы используются nupshot. Если этот ключ отсутствует, configure в каталоге mpe пробует самостоятельно найти эти файлы.

with-tkdir=TK_DIR

Этот ключ указывает, что tk находится в каталоге TK_DIR. Это может быть только версия 3, если Вы хотите использовать nupshot и в каталоге TK_DIR должны быть
`lib/libtcl.a' и `include/tk.h'. Это может быть тот же каталог, что и TCL_DIR. Если этот ключ отсутствует, configure в каталоге mpe пробует самостоятельно найти эти файлы.

with-wishloc=WISHLOC

Этот ключ определяет имя исполняемого файла wish для tcl/tk. Если этот ключ отсутствует, configure в каталоге mpe пробует самостоятельно найти версию. Опция используется только для nupshot и upshot. Примечание: Поскольку tcl и tk изменились и стали несовместимыми, мы в конечном итоге перестанем поддерживать любые инструменты, использующие tcl/tk. Более новые версии upshot, jumpshot написаны на Java.

with-jumpshot_home=JUMP_DIR

Этот ключ определяет путь к каталогу верхнего уровня, в котором установлен jumpshot. При конфигурировании mpich эта опция автоматически устанавливается по умолчанию. Она может быть переопределена. Если конфигурирования mpich не было, Вам необходимо определить JUMP_DIR, чтобы конфигурировать jumpshot вместе с библиотекой mpe.

with-jumpshot_opts=JUMP_OPTS

Этот ключ позволяет Вам передать специальные опции
configure для jumpshot. К сожалению, из-за способа autoconf 2, которым он обрабатывает множественные аргументы `AC_ARG_WITH', может быть передан только один аргумент. Если необходимо больше опций, конфигурируйте jumpshot отдельно (см .разд. 9.2). Чтобы увидеть опции jumpshot, перейдите в каталог верхнего уровня jumpshot и наберите ./configure help или прочтите
INSTALL в этом каталоге.

with-slog_home=SLOG_HOME

Этот ключ определяет путь к каталогу верхнего уровня, в котором установлен SLOG-API. При конфигурировании SLOG-API вместе с mpich, опция автоматически конфигурируется по умолчанию. Здесь она может быть переопределена.

with-flib_path_leader=FLIB_PATH_LEADER

Этот ключ указывает, как определить путь к библиотеке Фортрана. Он устанавливается по умолчанию при конфигурировании mpich.

with-f77_extra_flag=F77_EXTRA_FLAG

Этот ключ используется для флагов Фортрана, используемых для компиляции, но не для компоновки. В настоящее время это используется для опции -f компилятора Absoft. При конфигурировании mpich это значение будет определено для Вас.

with-cflags=MPE_CFLAGS

Это необязательный ключ для пользователя, поддерживающий дополнительные CFLAGS для компилятора CC.

with-fflags=MPE_FFLAGS

Это необязательный ключ для пользователя, поддерживающий дополнительные FFLAGS для компилятора Фортрана.

Инструкции по инсталляции mpe

• Конфигурирование библиотеки mpe как части процесса конфигурации и построения mpich
• Конфигурирование библиотеки mpe как части существующей реализации MPI

Конфигурирование библиотеки mpe как части процесса конфигурации и построения mpich

-mpe_opts=MPE_OPTS
-jumpshot_opts=JUMP_OPTS

Пример 1: Конфигурирование mpich вместе с библиотекой mpe и jumpshot

В каталоге верхнего уровня mpich

./configure <mpich options>
make

Пример 2: Конфигурирование mpich вместе с tcldir и tkdir, заданных в качестве опций mpe для configure

В каталоге верхнего уровня mpich

./configure <mpich options>
-mpe_opts=with-tcldir=<path of tcldir>
-mpe_opts=with-tkdir=<path of tkdir> make

Пример 3: Конфигурирование mpich, библиотеки mpe и jumpshot с определением каталога инсталляции

В каталоге верхнего уровня mpich

./configure <mpich options> -prefix=<install directory>
make

Это полезно, если Вы желаете установить mpich, библиотеку mpe и jumpshot в общедоступное место, чтобы другие пользователи могли ими пользоваться. Чтобы установить все три пакета в инсталляционный каталог, наберите

make install

Пример 4: Конфигурирование mpich вместе с библиотекой mpe, но без jumpshot

В каталоге верхнего уровня mpich

./configure <mpich options> -mpe_opts=enable-jumpshot=no
make

Пример 5: Конфигурирование mpich без библиотеки mpe и jumpshot

В каталоге верхнего уровня mpich

./configure <mpich options> -nompe
make

Конфигурирование библиотеки mpe как части существующей реализации MPI

Пример 1: Конфигурирование mpe с SGI MPI и без jumpshot

В каталоге верхнего уровня mpe

./configure with-sgi -libdir=<directory path of libdir>

./configure with-sgi64 -libdir=<directory path of libdir>
make

with-jumpshot_home

Пример 2: Конфигурирование mpe с IBM MPI и jumpshot

В каталоге верхнего уровня mpe

./configure with-sp -libdir=<directory path of libdir>
with-jumpshot_home=<directory path of jumpshot>
make

В каталоге верхнего уровня mpe

./configure with-sp -libdir=<directory path of libdir>
with-jumpshot_home=<directory path of jumpshot>
-bindir=<directory path of bindir>
make

Пример 3: Конфигурирование mpe с существующей реализацией mpich и jumpshot

В каталоге верхнего уровня mpe

./configure with-mpich=<directory path of mpich>
with-mpichdev=<library subdirectory for mpich>
make

with-jumpshot_home

Пример 4: Конфигурирование mpe с SGI MPI и с передачей опций configure для jumpshot В каталоге верхнего уровня mpe

./configure with-sgi -libdir=<directory path of libdir>
with-jumpshot_home=<directory path of jumpshot>
with-jumpshot_opts=<jumpshot option>
make

Примеры программ mpe

• LOG_LIB = путь связи, необходимый для связи с библиотекой регистрации
• TRACE_LIB = путь связи, необходимый для связи с библиотекой трассировки
• ANIM_LIB = путь связи, необходимый для связи с библиотекой анимации
• FLIB_PATH = путь связи, необходимый для связи программ на Фортране с библиотекой регистрации

В процессе сборки с каждой из указанных выше библиотек будет скомпонована небольшая программа на С `cpi' (расположена в каталоге `mpe/contrib/test'). В сообщениях вывода make будут присутствовать строки, сообщающие о каждой успешной компоновке. Небольшая программа на Фортране `fpi' в каталоге `mpe/contrib/test' будет скомпонована с библиотекой регистрации через FLIB_PATH. Информация об успешной компоновке также будет присутствовать в выводе make. Если тесты по компоновке будут успешно завершены, то эти пути к библиотекам будут также использоваться для Ваших программ.

mpeinstall

Визуализация поведения программ

• Upshot
• jumpshot
  • Опции конфигурирования
  • Инструкции по инсталляции
  • Построение и использование Jumpshot-3

Upshot

Чтобы использовать upshot для просмотра log-файла, выполните

make cpilog mpirun -np 4 cpilog
upshot cpilog.log

jumpshot

jumpshot

jumpshot <имя файла slog>

• Опции конфигурирования
• Инструкции по инсталляции
• Построение и использование Jumpshot-3

Опции конфигурирования

Как часть конфигурирования mpich

.configure в каталоге mpich может вызвать configure в подкаталоге `mpe', который может вызвать configure в подкаталоге `jumpshot'. Это способ конфигурирования mpich по умолчанию, который может быть переопределен с использованием опции -nompe.

Как часть конфигурирования mpe.

configure в каталоге `mpe' может вызвать configure в каталоге `jumpshot'. Это происходит по умолчанию, если библиотека mpe конфигурируется вместе с mpich. С другой стороны, должна быть задана опция with-jumpshot_home=JUMP_HOME.

Сам по себе.

jumpshot можно конфигурировать с помощью configure <опции конфигурирования> в каталоге jumpshot. Наберите

./configure help

в каталоге верхнего уровня `jumpshot', чтобы увидеть список флагов и ключей.

Обязательные флаги и ключи:

with-bindir=DIR

Определяет каталог, в котором будут располагаться исполняемые файлы jumpshot. Без этого флага конфигурирование jumpshot невозможно. При конфигурировании вместе с mpich или библиотекой mpe это значение определяется автоматически (но может быть переопределено).

with-jumpshot_home=JUMP_HOME

Определяет путь к каталогу верхнего уровня, в который инсталлируется jumpshot. Без указания этого каталога jumpshot не будет конфигурироваться. При конфигурировании вместе с mpich это значение определяется автоматически (но может быть переопределено).

Необязательные флаги и ключи configure:

enable-echo

Включает полное отображение сообщений. По умолчанию выключено.

with-java=DIR

Определяет путь к каталогу верхнего уровня Java. Если этот ключ опущен,
configure пытается самостоятельно обнаружить java.

with-java_version=VERSION

Определяет версию Java. Если этот ключ опущен, configure пытается самостоятельно определить Вашу версию java.

Инструкции по инсталляции

Конфигурирование jumpshot как части конфигурирования mpich. В этой инсталляции jumpshot не требуются никакие флаги или ключи. Скрипты configure в каталогах mpich и mpe собирают необходимую информацию и передают их configure в каталоге jumpshot. Если configure в каталоге mpich не заданы никакие опции, jumpshot будет конфигурироваться со значениями по умолчанию. Пользователь может переопределить их, сконфигурировав mpich со следующими опциями:

-mpe_opts=MPE_OPTS
-jumpshot_opts=JUMP_OPTS

Пример 1: Конфигурирование mpich вместе с библиотекой mpe и jumpshot

В каталоге верхнего уровня mpich наберите

./configure <опции конфигурирования mpich>
make

В настоящее время, если mpich конфигурируется без библиотеки mpe, jumpshot не будет сконфигурирован (поскольку configure для mpe вызывает configure для jumpshot). Ниже приведены шаги для конфигурирования mpich и jumpshot без библиотеки mpe.

В каталоге верхнего уровня mpich наберите

./configure <опции конфигурирования mpich> -nompe
make

В подкаталоге jumpshot выполните

configure with-bindir=<путь к каталогу mpich/bin>
with-jumpshot_home=<путь к каталогу jumpshot>

В каталоге верхнего уровня mpich наберите

./configure <опции конфигурирования mpich>
-jumpshot_opts=with-jumpshot_opts=with-java=<путь к каталогу java>
make

with-jumpshot_opts

with-jumpshot_opts

Пример 4: Конфигурирование mpich вместе с библиотекой mpe и переопределением опции
jumpshot_home в configure для jumpshot.

В каталоге верхнего уровня mpich наберите

./configure <опции конфигурирования mpich>
-jumpshot_opts=with-jumpshot_opts=with-jumpshot_home=DIR
make

Конфигурирование jumpshot как части конфигурирования mpe.

Пример 1: Конфигурирование библиотеки mpe вместе с jumpshot и mpich (уже сконфигурированным и установленным)

В каталоге верхнего уровня mpe наберите

./configure with-mpich=<каталог верхнего уровня для mpich>
with-mpichdev=<подкаталог библиотеки mpich>
make

Пример 2: Конфигурирование библиотеки mpe вместе с jumpshot и SGI MPI

В каталоге верхнего уровня mpe наберите

./configure with-sgi -libdir=<путь к каталогу libdir>
with-jumpshot_home=<путь к каталогу jumpshot>
make

Пример 3: Конфигурирование библиотеки mpe вместе с IBM MPI без jumpshot

В каталоге верхнего уровня mpe наберите

./configure with-sp -libdir=<путь к каталогу libdir>
enable-jumpshot=no
make

Пример 4: Конфигурирование библиотеки mpe с заданным в качестве опции jumpshot каталогом java

В каталоге верхнего уровня mpe наберите

./configure <ключ реализации MPI>
with-jumpshot_opts=with-java=<путь к каталогу java>
make

Конфигурирование jumpshot самого по себе

Пример 1: Конфигурирование jumpshot

В каталоге верхнего уровня jumpshot наберите

./configure -bindir=<путь к каталогу двоичных файлов>
with-jumpshot_home=<путь к каталогу jumpshot>

Пример 2: Конфигурирование jumpshot с полным отображением сообщений

В каталоге верхнего уровня jumpshot наберите

./configure -bindir=<путь к каталогу двоичных файлов>
with-jumpshot_home=<путь к каталогу jumpshot>
enable-echo=yes

Файл log, создаваемый cpilog не очень интересен, поскольку cpi очень простая программа. Более интересные log-файлы можно найти в подкаталоге `profiling/upshot/logfiles' или подкаталоге `jumpshot/lib/logfiles'. Файл cpilog.c показывает, как настроить Ваш собственный код для создания log-файлов. Руководство пользователя [8] описывает, как связать код с версией mpich, которая создает log-файлы автоматически. Краткое описание программ каталога `examples/basic' содержится в файле README.

Построение и использование Jumpshot-3

Создание jumpshot-3:

Перейдите в каталог `$(MPICH)/jumpshot-3', наберите в командной строке configure. Если configure возвращает сообщение об ошибке, о том, что не может обнаружить верной версии Java, либо Вы хотите сконфигурировать jumpshot под определенную версию Java, выполните

./configure with-java=/homes/chan/java/jdk117_v3

make

Перейдите в каталог `$(MPICH)/jumpshot-3/bin', чтобы убедиться, что исполняемые файлы jumpshot и slog_print здесь. slog_print -это скрипт для запуска SLOG Java API для вывода информации в log-файлах. jumpshot - это скрипт для запуска инструмента визуализации jumpshot-3 для просмотра slog-файлов.

Если у Вас возникли вопросы, присылайте их на mpi-maint@mcs.anl.gov.

Интернационализация

Чтобы создать новый каталог с сообщениями, скопируйте файл `mpich.En_US.msg' в файл
`mpich.mylanguage.msg' и переведите его содержание. Значение `mylanguage' должно совпадать с одним из используемых в Вашей системе; например, `mpich.De_DE.msg' для немецкого языка. Многие системы помещают свои файлы NLS в каталог `/usr/lib/nls/msg'; Вы можете также проверить значение переменной окружения NLSPATH Вашей системы. Отметьте, что некоторые системы предлагают процедуры и программы для поддержки NLS, но не используют их и не устанавливают начальное значение NLSPATH.

Пользователи emacs могут проверить информацию Emacs в разделе ``European Display''. Команды

M-x standard-display-european
M-x iso-accents-mode

По умолчанию mpich использует значение NLSPATH для поиска каталогов с сообщениями. Если это окончится неудачно, он пробует поиск в `MPINLSPATH'. Если и это дейтсвие завершится неудачно, он использует английскую версию, закодированную в составе библиотеки.

Каталоги не всегда устанавливаются именно в это место. Вместо этого, Вы можете найти их в каталоге библиотеки для определенной архитектуры; например, в `mpich/rs6000/lib'.

Оценка производительности mpich

make
mpirun -np 2 mpptest -gnuplot > out.gpl

gnuplot out.gpl

load `out.gpl'

gnuplot
set term postscript eps
set output "foo.eps"
load 'out.gpl'

Программы mpptest и goptest имеют широкий спектр возможностей; опция -help выведет их список. Например, mpptest может автоматически определить длину сообщений, чтобы обнаружить любые изменения в поведении и может исследовать возможность перекрытия обмена сообщениями и вычислений. Эти программы написаны с использованием MPI и могут использоваться с любой реализацией MPI, не только с mpich. (Cм. configure в каталоге examples/perftest). Дополнительная информация доступна на http://www.mcs.anl.gov/mpi/mpptest. Оценка производительности может быть очень сложной. См. http://www.mcs.anl.gov/mpi/mpptest/hownot.html о наиболее общих ошибках тестирования. Работа [10] описывает эти вещи более подробно.

Figure: Пример вывода из mpptest

Среда программирования mpich

• Введение
• mpirun, переносимый скрипт запуска
• Команды компиляции и сборки программ

Введение

1. mpirun, переносимую команду запуска, так что программы MPI могут быть запущены одинаковым образом на многих различных системах.
2. mpicc и mpif77, скрипты компиляции и компоновки программ MPI на С и Фортране.
3. mpiCC и mpif90, скрипты компиляции и компоновки программ MPI на С++ и Фортране 90.
4. mpe - библиотеку полезных процедур, работающих вместе с MPI. Сейчас эта библиотека включает процедуры для создания log-файлов событий с временными отметками, простую библиотеку для параллельной графики X, процедуры для представления кода в виде последовательности блоков, и процедуры запуска отладчика при возникновении ошибки.
5. Набор предопределенных профилирующих библиотек. Стандарт MPI определяет механизм, в котором пользователь может ``обрамлять'' любой набор функций MPI кодом своих собственных функций, без доступа к исходным кодам реализации MPI. Мы предоставляем инструменты для создания такой профилирующей версии библиотеки MPI минимальными усилиями, а также три созданных заранее множества ``обрамлений'' для определения затрат времени в процедурах MPI, для подготовки log-файлов и для программной анимации.
6. upshot - инструмент анализа log-файлов, созданных функциями регистрации mpe или автоматической регистрацией в профилирующей библиотеке регистрации.
7. jumpshot - Java-версия для upshot и nupshot.

mpirun, переносимый скрипт запуска

mpirun -np 4 cpi

mpirun -help

Более подробную информацию об использовании mpirun можно найти в руководстве пользователя mpich.

Команды компиляции и сборки программ

-mpilog

Создает версию, которая генерирует log-файлы mpe.

-mpitrace

Создает версию, которая генерирует трассы.

-mpianim

Создает версию, которая генерирует анимацию в реальном времени.

-show

Показывает команды, которые можно использовать без их непосредственного запуска

mpicc -c foo.c
mpiCC -c foo.C
mpif77 -c foo.f
mpif90 -c foo.f90

mpicc -o foo foo.o
mpiCC -o foo foo.o
mpif77 -o foo foo.o
mpif90 -o foo foo.o

mpicc -o foo foo.o -lmpe

mpicc -o foo foo.с
mpiCC -o foo foo.С
mpif77 -o foo foo.f
mpif90 -o foo foo.f90

Дополнительная информация об использовании этих команд находится в руководстве пользователя mpich.

Проблемы

• Отсылка сообщений об ошибке
• Проблемы конфигурирования
  • Общие
  • Linux
  
  
• Проблемы построения mpich
  • Общие
  • Сети рабочих станций
  • Cray T3D
  • SGI
  • Linux
  • IBM SP
  • Compaq ULTRIX
  
  
• Проблемы тестирования
  • Общие

Отсылка сообщений об ошибке

• Версию mpich (например, 1.2.2)
• Вывод при запуске Вашей программы с аргументом -mpiversion (т.е.,
  mpirun -np 1 a.out -mpiversion)
• Вывод

  uname -a

  для Вашей системы. Если Ваша система - SGI, нужен также

  hinv

• Если проблема возникает со скриптом типа configure или mpirun, запустите скрипт с аргументом -echo (т.е., mpirun -echo -np4 a.out)
• Если Вы используете сеть рабочих станций, пришлите также вывод bin/tstmachines. Программа tstmachines обсуждается в руководстве пользователя.

Если у Вас возникло более одной проблемы, пожалуйста, присылайте их в отдельных сообщениях; это упрощает нашу обработку сообщений об ошибках.

Остальная часть этого раздела содержит информацию о устранении ошибок в mpich. Некоторая часть описывает проблемы, свойственные определенным средам, и дает соответствующие пояснения. Каждый раздел организован в форме ответов на вопросы, причем вопросы, относящиеся к более чем одной среде (рабочей станции, ОС), продолжаются вопросами для определенных систем. Проблемы с кластерами рабочих станций собраны в одном месте.

Проблемы конфигурирования

• Общие
• Linux

Общие

1. В: При попытке запустить configure, я получаю сообщения типа

   ./configure : синтаксическая ошибка в строке 20: ' (' не определена

   О: У Вас устаревшая версия Bourne Shell (sh). mpich требует, чтобы shell поддерживала процедуры; это было стандартом в большинстве Bourne Shell. Чтобы справиться с этим, Вы можете (а) получить дополненную версию от своего поставщика или (б) инсталлировать любую общедоступную замену shell.
2. В: configure сообщает, что компилятор не работает, но с ним все в порядке (он исполняет тест, который завершается без проблем).

   О: Возможно, Вы используете Bash shell (`/bin/bash') в качестве замены Bourne shell (`/bin/sh'). Нам сообщали что, например, в LINUX, Bash не всегда корректно возвращает результат выражения. Способом исправить это является использование другого shell, например `/bin/ash' в такой системе.

   Это может не работать на некоторых системах LINUX (любая shell не справится). Нам сообщили, что следующий фрагмент будет работать:

   1. В configure замените trap `rm -f confdefs*' 0 на trap `rm -f confdefs*' 1
   2. После завершения configure удалите файл `confdefs.h' вручную.
3. В: configure сообщает об ошибках в виде

   checking gnumake... 1: Плохой номер файла

   О: Некоторые версии bash shell некорректно обрабатывают перенаправление вывода. Либо обновите свою версию bash, либо запустите configure под другой shell (такой, как /bin/sh). Убедитесь, что используемая версия sh - это не псевдоним bash. configure пробует определить эту ситуацию и обычно выдает сообщение об ошибке.
4. В: configure сообщает, что числа с плавающей точкой не коммутативны! Как это исправить?

   О: Смотрите документацию Вашего компилятора. На RS/6000 используйте опцию -qnomaf. На некоторых других системах промежуточные результаты могут запоминаться в 80-битных регистрах (процессоры Intel); это также ведет к неправильному округлению. Вам необходимо заставить компилятор округлять до 64 бит.

Linux

1. В: Этап конфигурирования выдает сообщение:

   checking that the compiler f77 runs... no
   Fortran compiler returned non-zero return code
   Output from test was
   f2ctmp_conftest.f:
   MAIN main:

   О: Возможно, это вызвано проблемой с компилятором Фортрана в LINUX. Команда f77 в LINUX зачастую является скриптом shell, использующим программу f2c для преобразования программы на Фортране в С с последующей компиляцией ее компилятором С. Во многих версиях LINUX этот скрипт содержит ошибку, которая возвращает ненулевой код возврата даже при успешном завершении компиляции.

   Чтобы исправить эту ошибку, Вам необходим скорректированный скрипт f77. Если Вы можете исправить его сами, измените последние три строки

   case $cOPT in 2) $CC $G -o $OUTF $OFILES -lf2c -lm;; esac
   rc=$?
   exit $rc

   на строки

   case $cOPT in 2) $CC $G -o $OUTF $OFILES -lf2c -lm;; esac
   rc=$?
   trap 0
   exit $rc

2. В: Тест компоновки завершается в LINUX с ошибкой типа:

   overtake.o (.text+0x59): undefined reference to `MPI_COMM_WORLD'
   overtake.o (.text+0x81): undefined reference to `MPI_COMM_WORLD' ...

   О: Возможно, это вызвано проблемой с компилятором Фортрана в LINUX. Команда f77 в LINUX зачастую является скриптом shell, использующим программу f2c для преобразования программы на Фортране в С с последующей компиляцией ее компилятором С. Во многих версиях LINUX этот скрипт содержит ошибку, которая возвращает ненулевой код возврата даже при успешном завершении компиляции.

   Чтобы исправить эту ошибку, Вам необходим скорректированный скрипт f77. Если Вы можете исправить его сами, измените последние три строки

   case $cOPT in 2) $CC $G -o $OUTF $OFILES -lf2c -lm;; esac
   rc=$?
   exit $rc

   на строки

   case $cOPT in 2) $CC $G -o $OUTF $OFILES -lf2c -lm;; esac
   rc=$?
   trap 0
   exit $rc

3. В: Во время этапа конфигурирования иногда возникает сообщение

   /homes/me/mpich/configure: 134956160: Permission denied

   Что неверно?

   О: Это ошибка в Linux sh shell. shell пытается создать файл с именем `/tmp/t<processid>-sh' (например, `/tmp/t11203-sh'), но не может этого сделать. Это может произойти, если `/tmp' переполнен; однако, это может произойти и когда shell создала этот файл для другого пользователя ранее. (Вы можете увидеть, что произошло, запустив configure под управлением strace -f). Единственным решением будет уничтожение старых файлов в `/tmp' вашим системным администратором.

Проблемы построения mpich

• Общие
• Сети рабочих станций
• Cray T3D
• SGI
• Linux
• IBM SP
• Compaq ULTRIX

Общие

1. В: При запуске make для mpich возникает ошибка:

   ar: write error : No such file or directory
   *** Error code 1

   При этом все файлы доступны и имеют соответствующие права доступа.

   О: Проверьте наличие свободного пространства в `/tmp'. Эта ошибка иногда возникает, когда в `/tmp' не хватает места для копирования архива (эту операцию ar выполняет при дополнении библиотеки). Команда df /tmp покажет Вам объем свободного места. Убедитесь, что доступно вдвое большее пространство, чем нужно для библиотеки.

2. В: При запуске make для mpich возникает ошибка выполнения ranlib.

   О: Многие системы реализуют ranlib с помощью команды ar, и используют по умолчанию каталог `/tmp', полагая, что это будет наиболее быстрым (`/tmp' обычно расположен на локальном диске). К сожалению, большинство систем имеет чрезвычайно маленький раздел `/tmp', поэтому его использование связано с определенным риском. В некоторых случаях команда ar, используемая mpich, завершается успешно, поскольку она использует опцию l, заставляя ar работать с локальным каталогом вместо `/tmp'. С другой стороны, ranlib может использовать `/tmp' и не может быть исправлена.

   В некоторых случаях команда ranlib может Вам и не понадобиться. В этих случаях Вы можете произвести реконфигурирование с опцией -noranlib. Если Вам нужно использовать ranlib, либо уменьшите пространство, используемое в `/tmp', либо увеличьте размер этого раздела (Ваш системный администратор должен это сделать). При этом в `/tmp' должно быть как минимум 20-30 Mb свободного места.

3. В: При выполнении теста компоновки, компоновка не происходит и не может обнаружить процедуры MPI:

   /homes/them/burgess/mpich/IRIX32/ch_p4/bin/mpicc
   -o overtake overtake.o test.o
   ld: WARNING 126: The archive
   /homes/them/burgess/mpich/IRIX32/ch_p4/lib/libmpi.a
   defines no global symbols. Ignoring.
   ld: WARNING 84: /usr/lib/libsun.a is not used for resolving any symbol.
   ld: ERROR 33: Unresolved data symbol "MPI_COMM_WORLD"
   1st referenced by overtake.o
   ld: ERROR 33: Unresolved text symbol "MPI_Send"
   1st referenced by overtake.o
   ...

   О: Убедитесь, что программы ar и ranlib совместимы. GNU Ranlib устанавливается таким образом, что она используется поставщиками программ ar, с которыми она несовместима. Используйте в этом случае опцию -noranlib для configure.

Сети рабочих станций

1. В: При построении mpich он выдает ошибку на стадии make, подобную:

   making p4 in directory lib

   make libp4.a
   cc -Aa -g -I../include -I../../../../include -c p4_globals.c

   cc: ``/usr/include/netinet/in.h'', line 69: error 1000: Unexpected symbol:
   ``u_long''.
   cc: ``/usr/include/netinet/in.h'', line 127: error 1000: Unexpected symbol:
   ``u_short''.

   и т.д.

   О: Убедитесь, что cc имеет псевдоним (в С-shell выполните alias cc). Если он существует, либо отмените его, либо установите переменную окружения СС на полный путь к компилятору. Чтобы задать полный путь, выполните

   unalias cc
   setenv CC 1which cc'

   и выполните реконфигурирование.
2. В: При построении устройства ch_p4 возникает ошибка вида

   making p4 in directory lib

   make libp4.a
   cc -I../include -I../../../../include -c p4_globals.c
   cc -I../include -I../../../../include -c p4_MD.c
   cc -I../include -I../../../../include -c p4_error.c

   cc-142 cc: WARNING File = p4_error.c, Line = 152

   The number of old style and prototype parameters does not agree.
   cc-142 cc: WARNING File = p4_error.c, Line = 162

   The number of old style and prototype parameters does not agree.
   cc-142 cc: WARNING File = p4_error.c, Line = 169

   The number of old style and prototype parameters does not agree.
   cc-142 cc: WARNING File = p4_error.c, Line = 174

   The number of old style and prototype parameters does not agree.

   О: Это делается при описании обработчика сигналов и может быть проигнорировано. P4 использует SIG_IGN (игнорирование) и SIG_DFL (поведение по умолчанию), определенные в
   `/usr/include/signal.h'.

Cray T3D

1. В: При компоновке возникает ошибка

   mppldr-133 cf77: CAUTION
   Встречаются неудовлетворительные внешние ссылки.
   Неудовлетворительные внешние ссылки
   Entry name         Modules referencing entry
   GETARG (equivalenced to $USX1)

   MPIR_GETARG

   О: Вы должны определить компилятор Фортрана для configure с помощью агрумента -fc. Реализация mpich на Фортране использует общее расширение Фортрана,GETARG, для получения аргументов командной строки. Большинство систем исполнения Фортрана поддерживают его, но Cray использует вместо него вызов pxfgetarg (i, s, len (s), ierr). Вы можете исправить вручную файл `src/env/farg.f', чтобы вызвать правильную процедуру (заметьте, что configure всякий раз создает при запуске новый `farg.f' из `farg.f.in').

   На системе HP-UX версии 10 Вы можете выполнить конфигурирование с -fflags= +U77 и пересобрать mpich. Это уже выполняется по умолчанию.

   mpich уже пытается определить правильные имена процедур для доступа к командной строке. Если Вы обнаружили, что mpich не может сделать это корректно, отошлите сообщение об ошибке на mpi-bugs@mcs.anl.gov.

SGI

1. В: Построение программ на SGI Power Challenge завершается с ошибкой

   Signal: SIGSEGV in Back End Driver phase.
   > ### Error:
   > ### Signal SIGSEGV in phase Back End Driver processing aborted
   > f77 ERROR: /usr/lib64/cmplrs/be died due to signal 4
   > f77 ERROR: core dumped
   > *** Error code 2 (bu21)
   > *** Error code 1 (bu21)
   > *** Error code 1 (bu21)

   О: По нашей информации установка переменной окружения SGI_CC в -ansi исправляет эту проблему.
2. В: Построение программ на SGI с архитектурой IRIX32 завершается с ошибкой

   cc: Warning: -c should not be used with ucode -O3 -o32
       on a single file; use -j instead to get inter-module optimization.

   О: Поразительно, но стандартная опция -c не работает с компиляторами SGI, когда определены -O3 и -o32. Это ``свойство'' компилятора SGI и его невозможно обойти для mpich (кроме общего и непортируемого изменения всех Make-файлов). Вы можете лишь не использовать опцию -O3.

Linux

1. В: Тест компоновки завершается на Linux с ошибкой

   ...
   cc -o overtake overtake.o test.o -L/usr/local/mpich/LINUX/ch_p4/lib -lmpi
   overtake.o (.text+0x71): undefined reference to `MPI_COMM_WORLD'
   overtake.o (.text+0x82): undefined reference to `MPIR_I_DOUBLE'
   overtake.o (.text+0xe1): undefined reference to `MPI_COMM_WORLD'
   ...

   О: Нас информировали, что это связано с ошибкой в скрипте f77 в некоторых весиях LINUX. Попробуйте либо получить исправленную версию скрипта f77, либо переконфигурировать с опцией -nof77.
2. В: Построение для устройства ch_p4 завершается с ошибкой при использовании компилятора
   Compaq C.

   О: Существует несовместимость системных include-файлов (но не include-файлов mpich). Если Вы можете модифицировать `/usr/include/rpc/xdr.h', добавьте следующие строки в начало этого файла:

   #if defined (__DECC) || defined (__DECCXX)
   typedef long int int64_t;
   #endif

IBM SP

1. В: При попытке компоновки на IBM SP возникает ошибка mpirun:

   mpCC -o overtake overtake.o test.o

   -L/usr/local/src/Mpi/1.2.0/lib/rs6000/ch_eui -lpmich
   ld: 0711-317 ERROR: Undefined symbol: .mp_main
   ld: 0711-317 ERROR: Undefined symbol: .mp_environ
   ld: 0711-317 ERROR: Undefined symbol: .mpc_bsend
   ...

   О: Ваша реализация IBM может не содержать процедуры MPL, которые mpich использует для реализации MPI. Ваша система должна содержать версию MPI для IBM, и Вы должны использовать ее.

Compaq ULTRIX

1. В: При попытке построения make прерывается во время фазы очистки:

   amon:MPICH/mpich>make clean

   /bin/rm -f *.o *  nupshot *** Error code 1

   О: Это ошибка в поддержке shell в некоторых системах Compaq ULTRIX. Вы можете обойти ее, использовав

   setenv PROG_ENV SYSTEM_FIVE

   Конфигурирование с -make=s5make также сработает.

Проблемы тестирования

• Общие

Общие

1. В: Тест `pt2pt/structf' завершается с ошибкой

   0 - Error in MPI_ADDRESS: Invalid argument: Address of location given to
   MPI_ADDRESS does not fit in Fortran integer
   0Aborting program!

   О: Это не ошибка; это пробел в определении MPI-1, исправленный в MPI-2. Это указывает, что целые числа в Фортране недостаточно велики, чтобы содержать адрес. Это должно означать, что программы, написанные на Фортране, не должны использовать MPI_Address в этой системе.
2. В: Тест `env/timers' завершается с ошибкой

   Timer around sleep (1) did not give 1 second; gave 0.399949

   О: Низкоуровневое ПО, которое использует mpich, возможно использует сигнал SIGALRM, что запрещено программам пользователя. Это не ошибка (стандарт запрещает системам использовать любые сигналы), хотя это и неудобно. Одной из систем, использующих SIGALRM, является ПО IBM MPL/POE (устройство ch_mpl) для использования в высокопроизводительных переключателях параллельных компьютеров IBM SP.

Использование configure

Usage: configure with-arch=ARCH_TYPE -comm=COMM_TYPE

with-device=DEVICE
with-mpewithout-mpe
disable-f77disable-f90 with-f90nagwith-f95nag
disable-f90modules
disable-gencatdisable-doc
enable-c++disable-c++
enable-mpedbgdisable-mpedbg
enable-devdebugdisable-devdebug
enable-degubdisable-debug
enable-tracebackdisable-traceback
enable-long-longdisable-long-long
enable-long-doubledisable-long-double
-prefix=INSTALL_DIR

-c++=C++_COMPILERnoc++
-opt=OPTFLAGS
-cc=C_COMPILER-fc=FORTRAN_COMPILER
-clinker=C_LINKER-flinker=FORTRAN_LINKER
-c++linker=CC_LINKER
-cflags=CFLAGS-fflags=FFLAGS -c++flags=CCFLAGS
-optcc=C_OPTFLAGS-optf77=F77_OPTFLAGS
-f90=F90_COMPILER-f90flags=F90_FLAGS
-f90inc=INCLUDE_DIRECTORY_SPEC_FORMAT_FOR_F90
-f90linker=F90_LINKER
-f90libpath=LIBRARY_PATH_SPEC_FORMAT_FOR_F90
-lib=LIBRARY-mpilibname=MPINAME
-mpe_opts=mpe_OPTS
-make=MAKEPGM
-memdebug-ptrdebug-tracing -dlast
-listener_sig=SIGNAL_NAME
-cross
-adi_collective
-automountfix=AUTOMOUNTFIX
-noranlib-ar_nolocal
-rsh=RSHCOMMAND-rshnol
-noromio-file_system=FILE_SYSTEM
-p4_opts=P4_OPTS

ARCH_TYPE        =    тип архитектуры машины, для которойконфигурируется MPI 


COMM_TYPE		=		уровень взаимодействия или используемая опция 


DEVICE		=		используемое устройство взаимодействия 


INSTALL_DIR		=		каталог для установки MPI (необязательно) 


MPE_OPTS		=		опции для передачи configure для mpe 


P4_OPTS		=		опции для передачи p4 configure (device=ch_p4)


C++_COMPILER		=		по умолчанию использует xlC, g++, CC (необязательно)


OPTFLAGS		=		флаги оптимизации для передачи компилятору (например -g)


CFLAGS		=		флаги компилятора C


FFLAGS		=		флаги компилятора Фортран


MAKEPGM		=		используемая версия make 


LENGTH		=		длина сообщения, при которой ADI переключает протоколсообщений 

с коротких на длинные сообщения


AUTOMOUNTFIX		=		команды для исправления автомонтирования 


RSHCOMMAND		=		команда использования удаленной shell 


MPILIBNAME		=		имя для использования вместо mpich при упоминаниибиблиотеки MPI.

Если установлено, то данное имя используется вместоlibmpich.

Опция используется в системах с несколькими 

различнымиреализациями MPI.


FILE_SYSTEM		=		имя файловой системы, используемой ROMIO. Поддерживает на

данный момент nfs, ufs, pfs (Intel), piofs (IBM), hfs (HP), 


sfs (NEC), xfs (SGI).


SIGNAL_NAME		=		имя используемого устройством P4 (device=ch_p4) сигнала отом,

что требуется новое соединение. По умолчанию это SIGUSR1.

Пакеты, которые могут включаться в mpich

with-device=name        -Использовать именованное устройство для 

взаимодействия. Известные имена включают ch_p4, 


ch_mpl, ch_shmem, globus2. Если ничего не определено,

берется значение по умолчанию. Специальные опции

устройства определяются после имени устройства,

отделяясь двоеточием. Пример:

with-device=globus2:-flavor=mpi, nothreads 

with-romio=OPTIONS-		Использовать ROMIO для предоставления MPI

ввода-вывода из MPI-2 (по умолчанию). Опции включают

-file_system=fstype, где fstype может быть любой

комбинацией nfs, ufs, pfs (Intel), piofs (IBM), hfs (HP),


sfs (NEC), xfs (SGI), скомбинированные '+'. Если romio

не включается, не могут быть построены модули Fortran 90.

with-mpe		-		Создать среду mpe (по умолчанию)

with-f90nag		-		Выбрать компилятор NAG f90 для

Фортрана ( предварительная версия, предназначенная для

использования вместо компилятора Фортран 77)

with-f95nag		-		Выбрать компилятор NAG f95 для Фортрана

without-<опция>

enable-c++                    - Создать интерфейсы C++ для процедур MPI-1

(по умолчанию) 

enable-f77		-		Создать интерфейсы Фортран 77 для процедур MPI

(по умолчанию)

enable-weak-symbols		-		Использовать слабые обозначения для процедур MPI/PMPI.

Эта опция использует для профилирующего интерфейса

слабые обозначения, если они доступны (по умолчанию).

enable-debug		-		Разрешить поддержку отладчиков для доступа к очередям 

сообщений.

enable-traceback		-		Разрешить вывод стека вызовов, когда MPI и программы

пользователя создаются с помощью определенных компиляторов

(в настоящее время поддерживаются только определенные

версии gcc)

enable-mpedbg		-		Разрешить аргумент командной строки -mpedbg (например,

ошибки могут вызвать xterm, выполняющий отладчик).

Работает только с некоторыми рабочими станциями.

enable-sharedlib		-		Попытаться построить разделяемые библиотеки.Всегда

enable-sharedlib=dir				строит статические библиотеки. Если определен каталог,

библиотеки будут помещены в него. Опция используется

для помещения разделяемых библиотек в единое место на

локальных дисках кластера.

enable-f90modules		-		Создать поддержку модулей Фортран 90 (по умолчанию,

если найден компилятор Фортран 90 или 95). Если не

построен ROMIO, модули Фортран 90 не создаются.

enable-strict        - Попытаться построить mpich, используя опции strict в


GNU gcc.

enable-echo		-		Заставить configure сообщать о своих действиях

enable-devdebug		-		Разрешить отладочный код в ADI.

disable-<опция>

Заметки об использовании configure:

Рекомендации по использованию GNU configure советуют не использовать его для построения различных инструментов, а лишь для контроля некоторых базовых возможностей или вложенных пакетов. Наше использование configure не следует этим правилам, поскольку configure слишком удобен, и нам требуется гибкость, позволяющая пользователю создавать варианты mpich.

Несколько заметок о параметрах командной строки:

Вы можете выбрать разные компиляторы C и Фортран, используя ключи `-cc' и `-fc'. Переменные окружения `C' и `FC' могут также содержать значения этих параметров, но они могут переопределяться скриптом configure. Использование `-cc=$CC -fc= $FC' заставит configure использовать эти компиляторы.

Если указано `-with-cross=file', этот файл используется для кросс-компиляции. Файл должен содержать присваивания в форме

CROSS_SIZEOF_INT=4

egrep `CROSS_A_Z_=` configure | sed `s/=.*//g'

Опция `-opt' позволяет Вам задать опции оптимизации для компиляторов ( и С, и Фортран). Например, `-opt=-O' выбирает оптимизированную генерацию кода для большинства систем. `-optcc' и `-optf77' позволяют Вам задать опции только для компилятора С, либо Фортрана. Используйте
`-cflags' и `-fflags' для опций, не относящихся к компиляции.

Следует отметить, что опции `-opt' не передаются скриптам `mpicc', `mpif77', `mpiCC',
`mpif90'. Эти опции используются только при построении mpich.

Опция `-lib' позволяет Вам определить место библиотеки, котрая может понадобиться определенному устройству. Большинство устройств не требуют этой опции; см. инструкции по инсталляции для тех, которым это нужно

Опция `-make' может использоваться для выбора альтернативной программы make. Например, в системах FreeBSD, может потребоваться -make=gnumake, поскольку make, унаследованный из BSD 4.4, не поддерживает операции включения (используя вместо этого форму .include, не такую, как в других make); опция используется в утилите wrappergen.

Опция `disable-short-longs' может использоваться для запрета использования типов С `long long' (общее расширение) и `long double' (ANSI/ISO C), когда их размер соответствует размеру типов `long' и `double'. Некоторые системы позволяют такие длинные типы С, но генерируют предупреждение, когда они используются; эта опция может использоваться для устранения этих сообщений (и поддержки этих типов). `disable-long-long' отключает только `long long'; ` disable-long-double' отключает только `long double'.

Опция `ar_nolocal' упреждает команду архива библиотеки от попыток использования локального каталога для временного хранения. Эту опцию нужно использовать (а) когда в разделе, на котором расположен mpich, недостаточно места (менее 20 Mb) и (b) когда места достаточно в /tmp (или в месте для помещения временных файлов по умолчанию).

Опция `-noranlib' пропускает шаг `ranlib' (необходимый в некоторых системах для создания объектной библиотеки). Это особенно полезно для систем, в которых `ranlib' необязателен (возможен, но не нужен; поскольку он возможен, configure использует его заодно), но может не сработать (некоторые `ranlib' реализованы, как скрипты с использованием `ar'; если они не используют локальный каталог, они могут не сработать, уничтожив в процессе библиотеку, если в каталоге /tmp не достаточно места). Это встречается в некоторых OSF-системах.

Опция `-memdebug' создает избыточный отладочный код внутренней памяти. Это нужно использовать только, если Вы пытаетесь найти проблему с памятью (это может помочь найти проблемы с памятью и в коде пользователя). Запуск программ с опцией `-mpidb memdump' создает после вызова `MPI_Finalize' дамп всей занятой памяти, выделенной MPI. Например, будет указан созданный пользователем тип данных, который позже не был освобожден.

Опция `-tracing' позволяет трассировку внутренних вызовов. Это нужно использовать только для отладки самой реализации mpich.

Опция `-dlast' позволяет трассировать самые последние действия, выполненные устройством. Это может быть вывод при возникновении сигнала (типа SIGINT), ошибки или вызова специальной процедуры. Для этой опции существуют издержки по производительности, но она может быть полезна для разработчиков, пытающихся отладить проблему.

Опция `-rsh' позволяет Вам выбрать альтернативную команду для удаленной shell (по умолчанию, configure использует `rsh' или `remsh' из переменной `PATH'). Если Ваш shell не поддерживает опцию `-l' (некоторые AFS-версии rsh имеют этот недостаток), укажите также опцию `-rshnol'. Эти опции полезны только при построении сетевой версии mpich (т.е. `with-device=ch_p4').

Специальные опции настройки:

Существует ряд опций для настройки ADI (Abstract Device Interface - интерфейс абстрактного устройства), являющегося интерфейсом передачи сообщений нижнего уровня. Эти опции не нужно использовать, пока Вы не уверены в том, что Вы делаете.

Опция `-pkt-size=LENGTH' позволяет Вам выбрать длину сообщений, при которой ADI переключается с короткого на длинный формат сообщений. LENGTH должна быть положительной.

Опция `-adi_collective' позволяет ADI предоставить некоторые коллективные операции в дополнение к базовым операциям "точка-точка". В настоящее время большинство систем не поддерживают эту опцию (она игнорируется), а на других она недостаточно протестирована.

Примерное использование configure:

Чтобы создать mpich для использования на sun4 с SunOS, в качестве устройства ch_p4, и с каталогом установки, равным текущему каталогу:

./configure with-device=ch_p4 with-arch=sun4 make

ch_nx            (стандартные вызовы Intel NX),


ch_mpi		(стандартные вызовы IBM EUI или MPL),


ch_p4		(p4),


globus2		(Globus:globus_io/vMPI),


ch_meiko		(для Meiko CS2, использую библиотеку совместимости NX),


ch_shmem		(системы с разделяемой памятью, типа SMP),


ch_lfshmem		(системы с разделяемой памятью, типа SMP; используют

неблокирующиеся буферы сообщений),


ch_cenju3		(стандартные вызовы NEC Cenju-3)

meiko        (для Meiko CS2, используя библиотеку elan tport),


nx		(Intel Paragon),


t3d		(Cray T3D, используя библиотеку Cray shmem),


ch_nc		(стандартные вызовы nCube, требует -arch=ncube),


ch_cmmd		(стандартные вызовы TMC CM-5 CMMD)

Известные архитектуры включают (регистр важен)

sun4                (SUN OS 4.x)


solaris		(Solaris)


solaris86		(Solaris on Intel platforms)


hpux		(HP UX)


sppux		(SPP UX)


rs6000		(AIX for IBM RS6000)


sgi		(Silicon Graphics IRIX 4.x, 5.x, 6.x)


sgi5		(Silicon Graphics IRIX 4.x on R4400's, для MESHINE)


IRIX		(то же, что и sgi)


IRIX32		(IRIX с 32-битными объектами -32)


IRIXN32		(IRIX c -n32)


IRIX64		(IRIX с 64-битными объектами)


alpha		(DEC alpha)


intelnx		(Intel i860 или Intel Delta)


paragon		(Intel Paragon)


tflops		(Intel TFLOPS)


meiko		(Meiko CS2)


CRAY		(CRAY XMP, YMP, C90, J90, T90)


cray_t3d		(CRAY T3D)


freebsd		(PC клоны на FreeBSD)


netbsd		(PC клоны на NetBSD)


LINUX		(PC клоны на LINUX)


LINUX_ALPHA		(Linux на процессорах Alpha)


ksr		(Kendall Square KSR1 и KSR2)


EWS_UX_V		(NEC EWS4800/360AD рабочие станции. Не тестировалось.)


UXPM		(UXP/M. Не тестировалось.)


uxpv		(uxp/v/ Не тестировалось.)


SX_4_float0

(NEC SX-4; Формат с плавающей точкой 0

Удовлетворяет стандарту IEEE 754.

С:    sizeof (int)    = 4;sizeof (float)    = 4


FORTRAN: sizeof (INTEGER)= 4;sizeof (REAL)    = 4)


SX_4_float1

(NEC SX-4; Формат с плавающей точкой 1

Формат с плавающей точкой IBM.

С:    sizeof (int)    = 4;sizeof (float)    = 4


FORTRAN: sizeof (INTEGER)= 4;sizeof (REAL) = 4)


SX_4_float2

(NEC SX-4; Формат с плавающей точкой 2

Формат с плавающей точкой CRAY.

С:    sizeof (int)    = 4;sizeof (float)    = 8


FORTRAN: sizeof (INTEGER)    = 8;sizeof (REAL)    = 8

!!!ВНИМАНИЕ!!! Версия не работает с процедурами Фортран


sizeof (INTEGER) != sizeof (int))


SX_4_float2_int64

(NEC SX-4; Формат с плавающей точкой 2 и 64-битными целыми

С:    sizeof (int)    = 8;sizeof (float)    = 8


FORTRAN: sizeof (INTEGER)= 8;sizeof (REAL)    = 8)

Для многопроцессорных SGI (with-arch=IRIX), работающих с устройствами ch_p4, используйте -comm=ch_p4, чтобы отключить использование устройства коммуникации p4 через разделяемую память и -comm=shared, чтобы включить использование устройства коммуникации p4 через разделяемую память. По умолчанию используется устройство коммуникации через разделяемую память.

Остальное может быть определено.

Устаревшие возможности

• Получение Tcl, Tk и wish
• Устаревшие системы
• mpireconfig, способ создания make-файлов

Получение Tcl, Tk и wish

Вы должны получить tcl7.3.tar.Z и tk3.6.tar.Z (а также заплатку tk3.6p1.patch). Более поздние версии tcl и tk не совместимы с этими и не работают с nupshot. Программа upshot модифицирована для работы как с tk 3.6, так и с tk 4.0.

Необходимо, чтобы программа wish была доступна пользователям; другие части tcl и tk можно не устанавливать (но убедитесь в том, что все необходимое для wish установлено).

Для сборки Tcl и Tk мы рекомендуем следующий подход:

1. Поместите упакованные файлы tar и заплатку в пустой каталог, желательно в локальной (не NFS) файловой системе, например в `/tmp' (убедитесь в том, что в этой файловой системе достаточно места).
2. Распакуйте файлы tar:

   gunzip -c tcl7.3.tar.Z | tar xf -
   gunzip -c tk3.6.tar.Z | tar xf -

3. Примените заплатку tk:

   cd tk3.6
   patch -p 1 < ../tk3.6p1.patch
   cd ..

   (Отметьте, что используется patch -p; новые версии patch требуют аргумента и правильным в этом случае будет такое значение; другие версии patch могут потребовать -p1 (без пробела между p и 1)).
4. Сконфигурируйте Tcl. Укажите каталог инсталляции, ясно показывающий версию Tcl и Tk. Например, для создания Tcl и установки его в `/usr/local/tcl73tk36' используйте

   cd tcl7.3
   ./configure -prefix=/usr/local/tcl73tk36

5. Создайте и инсталлируйте Tcl. Прежде чем Вы сделаете make install, убедитесь, что каталог, указанный в аргументе -prefix для configure, существует.

   mkdir /usr/local/tcl73tk36
   make
   make install

6. Сконфигурируйте, создайте и инсталлируйте tk. Используйте для Tk тот же каталог инсталляции, что и для Tcl:

   cd ../tk3.6
   ./configure -prefix=/usr/local/tcl73tk36
   make
   make install

setenv TCL73TK36_DIR /usr/local/tcl73tk36

Устаревшие системы

configure with-device=ch_nx -arch=paragon

1. В: При построении на Paragon получены следующие сообщения об ошибке

   PGC-W-0115-Duplicate standart type (init.c: 576)
   PGC/Paragon Paragon Rel R5.0: compilation completed with warnings
   PGC-W-0115-Duplicate standart type (init.c: 576)
   PGC/Paragon Paragon Rel R5.0: compilation completed with warnings

   О: Это происходит из-за невозможности обработки или игнорирования компилятором long long. Эти предупреждения не наносят вреда.
2. В: При компиляции или запуске программ на Фортране возникают ошибки.

   О: Программы на Фортране должны использовать абсолютный путь к файлу `mpif.h' из-за ошибки в компиляторе Фортрана (он просматривает каталоги в неправильном порядке).

1. В: Проверка компоновки на Intel i860 завершается с ошибкой

   icc -o overtake overtake.o test.o -L//mpich/lib/intelnx/ -lmpi -lnode
   /usr/ipcsXDEV/i860/bin/ld860: Error: undefined symbol `_MPI_Keyval_create'
   /usr/ipcsXDEV/i860/bin/ld860: Fatal: no output file created

   О: Возможно, Вы пытаетесь построить mpich на древнем 386-ом под управлением System V выпуск 2. Эта версия Unix имеет очень жесткие ограничения на длину имен файлов (более жесткие, чем нам хотелось бы). Главной проблемой здесь является имя файла `mpich/src/context/keyval_create.c', которое слишком длинное для этой системы и некорректно архивируется. Лучше создать mpich на другой, более современной системе (например, Sun под управлением SunOS или Solaris).

mpireconfig, способ создания make-файлов

mpireconfig Makefile

Благодарности

Bibliography

1

Ralph Butler and Ewing Lusk. User's guide to the p4 parallel programming system. Technical report ANL-92/17, Argonne National Laboratory, October 1992.

2

Ralph Butler and Ewing Lusk. Monitors, messages, and clusters: The p4 parallel programming system. Parallel Computing, 20: 547-564, April 1994. (Also Argonne National Laboratory Mathematics and Computer Science Division preprint P362-0493).

3

I. Foster, J. Geisler, W. Gropp, N. Karonis, E. Lusk, G. Thiruvathukal, and S. Tuecke. A wide-area implementation of the Message Passing Interface. Parallel Computing, 24 (11), 1998.

4

I. Foster and C. Kesselman. Globus: A metacomputing infrastructure toolkit. International Journal of Supercomputing Applications, 11 (2):115-128, 1997.

5

Ian Foster and Nicholas T. Karonis. A grid-enabled MPI: Message passing in heterogeneous distributed computing systems. In Proceedings of SC98. IEEE, November 1999. http://www.supercomp.org/sc98.

6

William Gropp and Ewing Lusk. An abstract device definition to support the implementation of a high-level message-passing interface. Technical Report MCS-P342-1193, Argonne National Laboratory, 1993.

7

William Gropp and Ewing Lusk. Scalable Unix tools on parallel processors. In Proceedings of the Scalable High Performance Computing Conference, pages 56-62. IEEE, 1994.

8

William Gropp and Ewing Lusk. User's guide for mpich, a portable implementation of MPI. Tech-
nical Report ANL-96/6, Argonne National Laboratory, 1996. The updated version is
at ftp://ftp.mcs.anl.gov/pub/mpi/userguide.ps.

9

William Gropp and Ewing Lusk. A high-performance MPI implementation on a shared-memory vector supercomputer. Parallel Computing, 22 (11):1513-1526, January 1997.

10

William Gropp and Ewing Lusk. Reproducible measurements of MPI performance characteristics. Technical Report ANL/MCS-P755-0699, Mathematics and Computer Science Division, Argonne National Laboratory, June 1999.

11

William Gropp, Ewing Lusk, Nathan Doss, and Anthony Skjellum. A high- performance, portable implementation of the MPI message-passing interface standard. Parallel Computing, 22:789-828, 1996.

12

Edward Karrels and Ewing Lusk. Performance analysis of MPI programs. In Jack Dongarra and Bernard Tourancheau, editors, Proceedings of the Workshop on Environments and Tools For Parallel Scientific Computing. SIAM Publications, 1994.

About this document ...

This document was generated using the LaTeX2HTML translator Version 2002-2-1 (1.70)

Copyright © 1993, 1994, 1995, 1996, Nikos Drakos, Computer Based Learning Unit, University of Leeds.
Copyright © 1997, 1998, 1999, Ross Moore, Mathematics Department, Macquarie University, Sydney.

The command line arguments were:
latex2html mpich_install.tex

The translation was initiated by Alex Otwagin on 2002-12-16

Руководство по инсталляции mpich, переносимой реализации MPI, версии 1.2.2

• Contents
• Быстрый запуск
• Получение и распаковка дистрибутива
• Документация
• Конфигурирование mpich
  • Конфигурирование mpich для работы с различными компиляторами.
  • Рабочие станции в общем.
  • Сети рабочих станций с устройством ch_p4
  • Сети рабочих станций с устройством ch_p4mpd.
  • Вычислительные решетки с устройством globus2
  • Процессоры массового параллелизма и большие многопроцессорные системы
  • Построение mpich
  • Подготовка mpich для отладки в TotalView
  • Фортран
    • Что делать, если нет компилятора Фортрана?
    • Фортран 90
    • Фортран 77 и Фортран 90
    • Модули Фортран 90
    • Конфигурирование для компилятора Absoft Fortran
    • Конфигурирование для множества компиляторов Фортрана
  • Специальные выпуски для гетерогенных сетей и устройства ch_p4
  • Настройка rsh
  • Конфигурация с помощью ssh
  • mpich и потоки
  • Процедуры MPI и PMPI
  
  
• Компиляция mpich
  • С++
  • Построение для множества устройств или архитектур
  
  
• Запуск программ MPI
  • Специальные дополнения о запуске в сети рабочих станций
    • Использование устройства ch_p4
    • Действия при автомонтировании.
    • Скорейший запуск задач для устройства ch_p4
    • Остановка серверов P4
    • Управление серверами
  • Использование демонов MPD для устройства ch_p4mpd
    • Инсталляция
    • Запуск и управление демонами MPD
  • Специальные дополнения о запуске в разделяемой памяти
  • NFS и MPI-IO
  
  
• Процесс тестирования
• Инсталляция mpich для коллективного использования
  • Команды пользователя
  • Установка документации
    • Страницы man
    • Примеры
  
  
• Библиотека MPE
  • Опции конфигурации
  • Инструкции по инсталляции mpe
    • Конфигурирование библиотеки mpe как части процесса конфигурации и построения mpich
    • Конфигурирование библиотеки mpe как части существующей реализации MPI
  • Примеры программ mpe
  • mpeinstall
  
  
• Визуализация поведения программ
  • Upshot
  • jumpshot
    • Опции конфигурирования
    • Инструкции по инсталляции
    • Построение и использование Jumpshot-3
  
  
• Интернационализация
• Оценка производительности mpich
• Среда программирования mpich
  • Введение
  • mpirun, переносимый скрипт запуска
  • Команды компиляции и сборки программ
  
  
• Проблемы
  • Отсылка сообщений об ошибке
  • Проблемы конфигурирования
    • Общие
    • Linux
  • Проблемы построения mpich
    • Общие
    • Сети рабочих станций
    • Cray T3D
    • SGI
    • Linux
    • IBM SP
    • Compaq ULTRIX
  • Проблемы тестирования
    • Общие
  
  
• Использование configure
• Устаревшие возможности
  • Получение Tcl, Tk и wish
  • Устаревшие системы
  • mpireconfig, способ создания make-файлов
  
  
• Благодарности
• Bibliography
• About this document ...

Руководство по инсталляции mpich, переносимой реализации MPI, версии 1.2.2

• Contents
• Быстрый запуск
• Получение и распаковка дистрибутива
• Документация
• Конфигурирование mpich
  • Конфигурирование mpich для работы с различными компиляторами.
  • Рабочие станции в общем.
  • Сети рабочих станций с устройством ch_p4
  • Сети рабочих станций с устройством ch_p4mpd.
  • Вычислительные решетки с устройством globus2
  • Процессоры массового параллелизма и большие многопроцессорные системы
  • Построение mpich
  • Подготовка mpich для отладки в TotalView
  • Фортран
    • Что делать, если нет компилятора Фортрана?
    • Фортран 90
    • Фортран 77 и Фортран 90
    • Модули Фортран 90
    • Конфигурирование для компилятора Absoft Fortran
    • Конфигурирование для множества компиляторов Фортрана
  • Специальные выпуски для гетерогенных сетей и устройства ch_p4
  • Настройка rsh
  • Конфигурация с помощью ssh
  • mpich и потоки
  • Процедуры MPI и PMPI
  
  
• Компиляция mpich
  • С++
  • Построение для множества устройств или архитектур
  
  
• Запуск программ MPI
  • Специальные дополнения о запуске в сети рабочих станций
    • Использование устройства ch_p4
    • Действия при автомонтировании.
    • Скорейший запуск задач для устройства ch_p4
    • Остановка серверов P4
    • Управление серверами
  • Использование демонов MPD для устройства ch_p4mpd
    • Инсталляция
    • Запуск и управление демонами MPD
  • Специальные дополнения о запуске в разделяемой памяти
  • NFS и MPI-IO
  
  
• Процесс тестирования
• Инсталляция mpich для коллективного использования
  • Команды пользователя
  • Установка документации
    • Страницы man
    • Примеры
  
  
• Библиотека MPE
  • Опции конфигурации
  • Инструкции по инсталляции mpe
    • Конфигурирование библиотеки mpe как части процесса конфигурации и построения mpich
    • Конфигурирование библиотеки mpe как части существующей реализации MPI
  • Примеры программ mpe
  • mpeinstall
  
  
• Визуализация поведения программ
  • Upshot
  • jumpshot
    • Опции конфигурирования
    • Инструкции по инсталляции
    • Построение и использование Jumpshot-3
  
  
• Интернационализация
• Оценка производительности mpich
• Среда программирования mpich
  • Введение
  • mpirun, переносимый скрипт запуска
  • Команды компиляции и сборки программ
  
  
• Проблемы
  • Отсылка сообщений об ошибке
  • Проблемы конфигурирования
    • Общие
    • Linux
  • Проблемы построения mpich
    • Общие
    • Сети рабочих станций
    • Cray T3D
    • SGI
    • Linux
    • IBM SP
    • Compaq ULTRIX
  • Проблемы тестирования
    • Общие
  
  
• Использование configure
• Устаревшие возможности
  • Получение Tcl, Tk и wish
  • Устаревшие системы
  • mpireconfig, способ создания make-файлов
  
  
• Благодарности
• Bibliography
• About this document ...

Contents

• Введение
• Компоновка и запуск программ
  • Скрипты для компиляции и компоновки приложений
  • Компиляция и компоновка без скриптов
  • Запуск через mpirun
  
  
• Специальные возможности различных систем
  • Программы MPMD
  • Кластеры рабочих станций и устройство ch_p4
  • Быстрый запуск через многоцелевого демона и устройство ch_p4mpd
  • Отладка программ MPI
  • Симметричные мультипроцессоры (SMP) и устройство ch_shmem
  • Вычислительные решетки: устройство globus2
  • Многопроцессорные системы
  
  
• Примеры программ MPI
• Библиотека полезных расширений MPE
  • Создание log-файлов
  • Формат log-файлов
  • Параллельная графика для X
  • Другие процедуры MPE
  • Профилирующие библиотеки
  • Просмотрщики log-файлов
  • Автоматическая генерация профилирующих библиотек
  • Инструменты управления профилирующей библиотекой
  
  
• Отладка программ MPI встроенными средствами
  • Обработчики ошибок
  • Аргументы командной строки для mpirun
  • Аргументы MPI для приложений
  • Аргументы p4 для устройства ch_p4
  • Аргументы командной строки для приложений
  • Запуск задач через отладчик
  • Запуск отладчика при возникновении ошибки
  • Присоединение отладчика к запущенной программе
  • Сигналы
  • Инструменты отладки
  
  
• Отладка программ MPI с помощью TotalView
  • Подготовка mpich для отладки в TotalView
  • Запуск программы mpich под управлением TotalView
  • Присоединение к работающей программе
  • Отладка с помощью TotalView
  
  
• Другая документация MPI
• В случае неудачи
  • Проблемы компиляции или компоновки программ на Фортране
  • Проблемы компоновки программ на С
  • Проблемы при запуске программ
  • Программы завершаются с ошибкой при старте
  • Программы завершаются с ошибкой после запуска
  • Проблемы ввода-вывода
  • Upshot и Nupshot
  
  
• Автоматическая генерация профилирующих библиотек
  • Написание определения обрамления
  
  
• Опции mpirun
• mpirun и Globus
  • Использование mpirun для создания скрипта RSL для Вас
  
  
• Устаревшие возможности
  • Более детальный контроль за компиляцией и компоновкой
  
  
• Bibliography

Новое в 1.2.2:

• Существенно улучшено устройство ch_p4mpd
• Улучшенная поддержка различных компиляторов Фортран и Фортран 90, включая вычисление во время компиляции констант Фортрана, используемых в реализации mpich.
• Улучшенное устройство globus2, предоставляющее большую производительность.
• Новый режим bproc для устройства ch_p4 поддерживает Scyld Beowulf.
• Множественные улучшения производительности TCP для устройств ch_p4 и ch_p4mpd.
• Множество исправлений и улучшений кода.
  См. www.mcs.anl.gov/mpi/ mpich/r1_2_2changes.html о полном списке изменений.

• Улучшенная поддержка различных компиляторов Фортран и Фортран 90. В частности, одна версия mpich может теперь быть построена с использованием нескольких различных компиляторов Фортрана; см. руководство по инсталляции (в doc/install.ps.gz) для пояснений.
• Облегчено использование компилятора С для программ MPI, использующих mpich, являющегося отличным от того, с помощью которого строился mpich; см. руководство по инсталляции.
• Известные проблемы и ошибки данной реализации документированы в `mpich/KnownBugs'.
• Существует раздел ЧаВО (Часто задаваемые ВОпросы) на
  http://www.mcs.anl.gov/mpi/mpich/faq.html. См. сюда, если вы получаете при запуске mpich сообщения вида ``permission denied'', ``connection reset by peer'', ``poll: protocol failure in circuit setup''.
• Статья о jumpshot доступна на ftp://ftp.mcs.anl.gov/pub/mpi/jumpshot.ps.gz. Статья о MPD доступна на ftp://ftp.mcs.anl.gov/pub/mpd.ps.gz.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.

Введение

Основные возможности mpich:

• Полное соответствие стандарту MPI 1.2, включая отмену передачи.
• Привязки C++ к стандарту MPI-2 доступны из функций MPI-1.
• Привязки к Фортрану 77 и Фортрану 90, включая `mpif.h' и модуль MPI.
• Версия для Windows NT доступна в качестве открытых исходных кодов. Инсталляция и использование этой версии отличается; это руководство относится только к Unix-версии mpich.
• Поддержка широкого ряда сред, включая кластеры SMP и компьютеры массового параллелизма.
• Следование большинству (но еще не всем) целям построения и инсталляции, рекомендуемым GNU, включая VPATH.
• Поддерживаются части MPI-2:
  • Большая часть MPI-IO поддерживается через реализацию ROMIO (См. `romio/README' о деталях).
  • Поддержка MPI_INIT_THREAD (но лишь MPI_THREAD_SINGLE).
  • Различные новые процедуры MPI_Info и MPI_Datatype.
• mpich также включает компоненты параллельной среды программирования, в том числе
  • Инструменты трассировки и регистрации, основанные на профилирующем интерфейсе MPI, включая расширяемый формат log-файла (SLOG).
  • Параллельные инструменты визуализации производительности (upshot и jumpshot).
  • Обширные тесты корректности и производительности.

Этот документ предполагает, что mpich уже создан и установлен в соответствии с инструкциями из руководства по инсталляции mpich.

Компоновка и запуск программ

• Скрипты для компиляции и компоновки приложений
  • Использование разделяемых бибилиотек
  • Фортран 90 и модуль MPI
  
  
• Компиляция и компоновка без скриптов
• Запуск через mpirun

Скрипты для компиляции и компоновки приложений

Поддерживаются также следующие специальные опции:

-mpilog

Создавать версию, генерирующую log-файлы MPE.

-mpitrace

Создавать версию с трассировкой.

-mpianim

Создавать версию, генерирующую анимацию в реальном времени.

-show

Показать команды, которые можно использовать без их действительного запуска.

mpicc -c foo.c
mpif77 -c foo.f
mpiCC -c foo.C
mpif90 -c foo.f

mpicc -o foo foo.o
mpif77 -o foo foo.o
mpiCC -o foo foo.o
mpif90 -o foo foo.o

mpicc -o foo foo.o -lm

mpicc -o foo foo.с
mpif77 -o foo foo.f
mpiCC -o foo foo.C
mpif90 -o foo foo.f

Заметьте, что хотя суффиксы .c для программ С и .f для программ Фортрана являются стандартными, такого же соглашения о суффиксах для программ на С++ и Фортране 90 нет. Примеры, показанные выше подходят ко многим, но не ко всем системам. mpich пытается определить приемлемые суффиксы, но не всегда в состоянии сделать это.

Вы можете переопределить выбор компилятора определением переменных окружения MPICH_CC,
MPICH_F77, MPICH_CCC, MPICH_F90. Однако, помните, что это будет работать, только если альтернативный компилятор совместим с компилятором по умолчанию (под совместимостью мы подразумеваем, что они используют те же самые размеры для типов данных и генерируют объектный код, который может использоваться библиотеками mpich). Если Вы хотите переопределить компоновщик, испорльзуйте переменные окружения MPICH_CLINKER, MPICH_F77LINKER, MPICH_CCLINKER, MPICH_F90LINKER.

• Использование разделяемых бибилиотек
• Фортран 90 и модуль MPI

Использование разделяемых бибилиотек

Чтобы создать разделяемые библиотеки для mpich, Вы должны конфигурировать и собирать mpich с опцией enable-sharedlib. Поскольку каждая Unix-система и практически каждый компилятор использует различные и зачастую несовместимые множества опций для создания разделяемых объектов и библиотек, mpich может не определить коректные опции. В настоящее время mpich воспринимает Solaris, GNU gcc (на большинстве платформ, включая LINUX и Solaris) и IRIX. Информацию о построении разделяемых библиотек на друих платформах можно присылать на mpi-bugs@mcs.anl.gov.

Когда разделяемые библиотеки построены, Вы должны сообщить командам компиляции и компоновки mpich об их использовании (причина, по которой разделяемые библиотеки не используются по умолчанию, будет пояснена ниже). Вы можете сделать это либо опцией командной строки -shlib или установкой переменной окружения MPICH_USE_SHLIB в значение yes. Например,

mpicc -o cpi -shlib cpi.c

setenv MPICH_USE_SHLIB yes
mpicc -o cpi cpi.c

Запуск программы, построенной с испоьзованием разделяемых библиотек, может быть очень сложным. Некоторые (большинство?) систем не запоминают, где находились разделяемые библиотеки, когда компоновался исполняемый файл! Вместо этого, они пробуют найти разделяемые библиотеки либо в каталоге по умолчанию (таком, как `/lib'), либо в каталоге, определяемом переменной окружения, такой, как LD_LIBRARY_PATH, либо в каталоге, определяемом агрументом командной строки, таким, как -R или -rpath (см. ниже более подробно). configure для mpich проверяет их и сообщает, когда исполняемый файл, построенный с разделяемыми библиотеками, вспоминает их размещение. Он также пытается использовать аргументы командной строки компилятора, чтобы заставить исполняемый файл вспомнить размещение разделяемых библиотек.

Если Вам необходимо установить переменные окружения, чтобы указать, где находятся разделяемые библиотеки mpich, Вам необходимо убедиться в том, что и процесс, из которого Вы запустили mpirun, и любые процессы, запущенные mpirun, получат переменную окружения. Простейший способ сделать это - установить переменную окружения внутри Вашего файла `.cshrc' (для пользователей csh или tcsh) или `.profile' (для пользователей sh или ksh).

Однако, установка переменной окружения внутри скриптов запуска может вызвать проблемы, если Вы используете несколько различных систем. Например, у Вас имеется единый файл `.cshrc', который Вы используете в SGI (IRIX) и Solaris. Вы не хотите установить LD_LIBRARY_PATH, чтобы указать SGI на Solaris-версию разделяемых библиотек mpich². Вместо этого, Вы можете пожелать установить переменную окружения перед запуском mpirun:

setenv LD_LIBRARY_PATH $LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/mpich/lib/shared
mpirun -np 4 cpi

ld.so.1: /home/me/cpi: fatal: libpmpich.so.1.0: open failed:
No such file or directory
Killed

Альтернативой использованию LD_LIBRARY_PATH и безопасного сервера является добавление опции к команде компоновки, предоставляющей путь для использования в поиске разделяемых библиотек. К сожалению, опция, которая Вам нужна, это ``добавить этот каталог в путь поиска'' (такая, какую Вы получаете, используя -L). Вместо этого, многие компиляторы предлагают только опцию ``заменить путь поиска на данный путь''³. Например, некоторые компиляторы позволяют использовать -Rpath:path:...:path для определения заменяемого пути. Тогда, если и mpich, и пользователь предоставляют путь поиска библиотек через -R, один из путей будет утерян. В итоге, mpicc и другие скрипты могут проверить наличие опции -R и создать универсальную версию, но сейчас они этого не делают. Вы можете, однако, предложить полный путь поиска самостоятельно, если Ваш компилятор поддерживает такие опции, как -R.

Все предшествующее может звучать как масса лишней работы и в некоторых случаях это так. Однако, для больших кластеров эти затраты окупаются: программы будут запускаться быстрее и более надежно, поскольку уменьшается трафик по сети и файловой системе.

Фортран 90 и модуль MPI

Компиляция и компоновка без скриптов

Например, чтобы определить флаги, используемые для компиляции и компоновки программ на С, Вы можете использовать эти команды, вывод которых показан для устройства ch_p4 на рабочей станции Linux.

% mpicc -compile_info
cc -DUSE_STDARG -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1
-DHAVE_STDARG_H=1 -DUSE_STDARG=1 -DMALLOC_RET_VOID=1
-I/usr/local/mpich/include -c

% mpicc -link_info
cc -DUSE_STDARG -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1
-DHAVE_STDARG_H=1 -DUSE_STDARG=1 -DMALLOC_RET_VOID=1
-L/usr/local/mpich/lib -lmpich

Запуск через mpirun

mpirun np 4 a.out

При выходе mpirun возвращает статус одного из процессов, обычно процесса с рангом 0 в
MPI_COMM_WORLD.

Специальные возможности различных систем

Для связывания множества многопроцессорных систем выбор устройства globus2, описанного в разд. 3.6, может быть лучшим, чем устройства ch_p4.

• Программы MPMD
• Кластеры рабочих станций и устройство ch_p4
  • Проверка Вашего списка машин
  • Использование безопасной shell
  • Использование безопасного сервера
  • Кластеры SMP
  • Гетерогенные сети и устройство ch_p4
  • Файл procgroup для P4
  • Настройка производительности P4
  • Использование специальных межсоединений
  • Использование разделяемых библиотек с устройством ch_p4
  
  
• Быстрый запуск через многоцелевого демона и устройство ch_p4mpd
  • Цели
  • Введение
  • Примеры
  • Как работают демоны
  • Запуск задач mpich под управлением MPD
  
  
• Отладка программ MPI
  • Подход printf
  • Использование коммерческого отладчика
  • Использование mpigdb
  
  
• Симметричные мультипроцессоры (SMP) и устройство ch_shmem
• Вычислительные решетки: устройство globus2
• Многопроцессорные системы

Программы MPMD

Кластеры рабочих станций и устройство ch_p4

• Проверка Вашего списка машин
• Использование безопасной shell
• Использование безопасного сервера
• Кластеры SMP
• Гетерогенные сети и устройство ch_p4
• Файл procgroup для P4
• Настройка производительности P4
• Использование специальных межсоединений
• Использование разделяемых библиотек с устройством ch_p4