>что я пропустил?
Поддержка USB встроена в чипсеты аж для i586 (по времени). Лично столкнулся. Не выведена только наружу. (Конечно, в большинстве своем эта часть чипсетов находилась в стадии разработки). Однако, для линуха, если не включить поддержку USB, на некоторых чипсетах могут быть проблемы с загрузкой ядра. Вероятно ты либо не то включил, либо не то отключил. :)
Для начала, включи USB. Из-за присутствия этого кода ядро не упадет.
Потом потихоньку отключай.
Я для себя вынес одно правило: сначала изучить железо, а уж потом конфигурировать ядро. (Это для нестандартных конфигураций).