>Казахстан отказался от перехода на летнее время.
>Что делать сервера обновляются по ntp и они уже засинхронизировали время с
>учетом перехода на летнее время.
>Что делать?
>Отказываться от синхронизации времени не намерян
Скачать более свежие файлы zoneinfo (надеюсь что там уже исправили), или исправить самому.
На всякий случай смотрите например http://www.twinsun.com/tz/tz-link.htm
P.S. А синхронизация времени здесь непричем. У вас с time() всё нормально, поломалось преобразование time() --> localtime().