The OpenNET Project / Index page

[ новости /+++ | форум | теги | ]

форумы  помощь  поиск  регистрация  майллист  вход/выход  слежка  RSS
"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."
Вариант для распечатки  
Пред. тема | След. тема 
Форум Разговоры, обсуждение новостей
Изначальное сообщение [ Отслеживать ]

"Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."  +/
Сообщение от opennews on 23-Июн-11, 16:23 
После шести с половиной лет разработки увидела свет (http://ggasoftware.com/opensource) первая стабильная версия универсального SDK для химической информатики под названием Indigo (http://ggasoftware.com/opensource/indigo). История Indigo как проекта с открытыми кодом ведёт отсчёт с ноября 2009 года, когда был опубликован комплект утилит с ограниченным API. На данный момент Indigo предоставляет унифицированный программный интерфейс для разработчиков на язвках C/C++, Java, C# и Python.


Краткий список возможностей:


-  Поддержка форматов представления структур молекул и реакций: Molfile, Rxnfile, SDF, RDF, CML, SMILES, SMARTS
-  Двумерный рендеринг структур молекул и реакций по стандартам IUPAC (в качестве движка используется cairo). Автоматическое вычисление координат атомов в 2D
-  Вычисление "Canonical SMILES" - представления молекулярной структуры, инвариантного относительно перестановок атомов
-  Проверка точного совпадения структур молекул или реакций (Exact matching), п...

URL: http://ggasoftware.com/opensource
Новость: http://www.opennet.me/opennews/art.shtml?num=30974

Ответить | Правка | Cообщить модератору

Оглавление

Сообщения по теме [Сортировка по времени | RSS]


1. "Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."  +4 +/
Сообщение от Бедный бывший разработчик Novell on 23-Июн-11, 16:23 
Вот это круть, вот и химпром обопенсорсился. Ура!
Ответить | Правка | ^ к родителю #0 | Наверх | Cообщить модератору

2. "Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."  +/
Сообщение от Аноним (??) on 23-Июн-11, 18:07 
А говорят в опенсорс специализованного софта нет...
Ответить | Правка | ^ к родителю #0 | Наверх | Cообщить модератору

3. "Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."  +/
Сообщение от Аноним (??) on 23-Июн-11, 21:02 
Еще как есть! И медицинский софт (при чем реалтаймовый для больниц и поддержки жизнедеятельности), и математика, и химия с биологией. Не слушай троллей, они много чего наговорить могут :)
Ответить | Правка | ^ к родителю #2 | Наверх | Cообщить модератору

5. "Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."  +/
Сообщение от name (??) on 24-Июн-11, 00:02 
например, что?
Ответить | Правка | ^ к родителю #3 | Наверх | Cообщить модератору

6. "Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."  +5 +/
Сообщение от Варщик on 24-Июн-11, 09:44 
>например, что?

Например HyperChem, NWChem, CFOUR, Columbus, GAMESS US, Priroda, MRCC, OpenThermo, а так же в некотором роде аналог Индиги Chemistry Development Kit.

Ответить | Правка | ^ к родителю #5 | Наверх | Cообщить модератору

8. "Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."  +/
Сообщение от Dmitry Pavlov on 24-Июн-11, 11:57 
Ещё RDKit, OpenBabel. Эти аналоги являются более близкими, т.к. написаны на C++.
Ответить | Правка | ^ к родителю #6 | Наверх | Cообщить модератору

7. "Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."  +1 +/
Сообщение от Варщик on 24-Июн-11, 09:50 
>Ура!

Действительно ура, т.к. любой SDK позволяет в потенциале расширить список химсофта в разы.

Ответить | Правка | ^ к родителю #5 | Наверх | Cообщить модератору

4. "Релиз SDK для химической информатики Indigo 1.0 и сопутствую..."  +/
Сообщение от Антоним on 23-Июн-11, 23:06 
он есть далеко не везде. Топик это таки ближе к академическим задачам, а это один из основных источников в опенсорсе.
Ответить | Правка | ^ к родителю #2 | Наверх | Cообщить модератору

Архив | Удалить

Рекомендовать для помещения в FAQ | Индекс форумов | Темы | Пред. тема | След. тема




Партнёры:
PostgresPro
Inferno Solutions
Hosting by Hoster.ru
Хостинг:

Закладки на сайте
Проследить за страницей
Created 1996-2024 by Maxim Chirkov
Добавить, Поддержать, Вебмастеру