Если тяжелый апач и много соединений, контент долго генерируется, но может
кэшироваться, или наличие большого
процента "медленных клиентов" - то значительного прироста производительности
можно достигнуть используя mod_accel.
Если в CGI скриптах используются SQL запросы: оптимизация базы, оптимизация
запросов (EXPLAIN для pgsql),
использование индексов, частые vacuum для pgsql и прежде всего кэширование типовых запросов.
Если просто запускается много мелких скриптов: mod_perl или fast_cgi.
Плюс, вынесение из apache лишних модулей, отдельный web-сервер для раздачи статики и картинок.